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三角褐指藻pds基因生物信息學與誘導表達分析

發(fā)布時間:2024-12-11 21:45
   巖藻黃素是一類具有重要藥用價值和開發(fā)價值的新型海洋藥物,八氫番茄紅素脫氫酶(PDS)是三角褐指藻類巖藻黃素生物合成途徑中的一個重要的限速酶。為了更好地開發(fā)和利用巖藻黃素,通過RT-PCR克隆了三角褐指藻pds基因(Ptpds,Gen Bank序號:XM002184476.1)c DNA全長序列,并從基因?qū)用娣治隽送庠凑T導子對巖藻黃素生物合成的誘導機制,進一步探究Ptpds的結(jié)構(gòu)和表達特性。結(jié)果表明,Ptpds基因cDNA全長2 442 bp,開放閱讀框(ORF)為1 773 bp,編碼589個氨基酸,并含有一個NAD(P)-binding結(jié)構(gòu)域;蛋白分子結(jié)構(gòu)預測結(jié)果表明,三角褐指藻PDS蛋白(PtPDS)分子呈親水性,含有轉(zhuǎn)運肽、信號肽、跨膜結(jié)構(gòu)域等結(jié)構(gòu)。系統(tǒng)進化樹分析顯示,PtPDS與新型微藻的PDS蛋白親緣關(guān)系較近,且在所選取的藻類中進化地位較為原始。誘導表達結(jié)果表明,Me JA、ASA、AA、ACS等4種誘導子均能促進Ptpds基因的表達,且在4種誘導子處理下,三角褐指藻中的巖藻黃素含量變化與Ptpds基因的表達水平變化呈現(xiàn)高度的一致性,說明Ptpds基因是...

【文章頁數(shù)】:8 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 三角褐指藻的培養(yǎng)與處理
    1.2 三角褐指藻總RNA的提取及基因序列的獲得
    1.3 三角褐指藻pds基因生物信息學分析
    1.4 4種誘導子對三角褐指藻pds基因轉(zhuǎn)錄的影響
    1.5 巖藻黃素的提取及含量測定
2 結(jié)果與分析
    2.1 三角褐指藻pds基因序列分析
    2.2 三角褐指藻PDS蛋白 (Pt PDS) 的生物信息學分析
    2.3 4種誘導子對三角褐指藻巖藻黃素含量以及pds基因表達水平的影響
3 討論
4 結(jié)論



本文編號:4016326

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