為初步揭示磁受體IscA1在紫色紅曲霉中的生物學(xué)功能,采用同源克隆方法,經(jīng)PCR擴(kuò)增和DNA測(cè)序,獲得紫色紅曲霉(Monascus purpureus SKY219)中 IscA1的編碼區(qū)序列。進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),IscA1蛋白具有典型的Fe-S簇生物合成超家族和磁受體的保守結(jié)構(gòu)域,含有60個(gè)可能的磷酸化修飾位點(diǎn),為不穩(wěn)定的親水蛋白,主要定位于線粒體。其二、三級(jí)結(jié)構(gòu)組成以無規(guī)則卷曲為主,其次是α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角。蛋白互作的分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),IscA1可以與Fe-S簇裝配輔助蛋白IscA2及Grx5發(fā)生非特異性結(jié)合,IscA1和Grx可以被分子伴侶DnaJ蛋白激活,IscA1和不同藍(lán)光受體蛋白之間存在較強(qiáng)的親和力。表明IscA1在紫色紅曲霉的Fe-S簇合成和磁感應(yīng)中發(fā)揮重要作用。

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圖1IscA1的DNA擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖

表2所用到的分析工具和方法Table2Analysistoolsandmethodsusedinthisstudy軟件Software網(wǎng)址Website功能Function參數(shù)設(shè)置ParametersettingsMEGA7https://w....

圖8IscA1的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

軟件SWISS-MODEL模擬的IscA1的三級(jí)結(jié)構(gòu)如圖10所示。IscA1以細(xì)長(zhǎng)嗜熱聚球藻(ThermosynechococcuselongatusBP-1)為模板，二者的相似度為37%,覆蓋度為43%。模擬結(jié)果顯示，三維結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲和β-折疊為主，還有比較典型的α-螺....

圖9IscA1的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

圖8IscA1的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)圖10IscA1的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

圖10IscA1的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

圖9IscA1的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)2.9IscA1的亞細(xì)胞定位分析

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