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阿爾茲海默病關(guān)聯(lián)的膽固醇調(diào)節(jié)基因變異及其機制研究

發(fā)布時間:2024-04-14 02:28
  背景:阿爾茲海默病(Alzheimer’s Disease,AD)是與增齡相關(guān)、以漸進性認知功能障礙和記憶減退為主要癥狀、最常見的癡呆類型。作為老年期復(fù)雜中樞神經(jīng)系統(tǒng)退行性變性疾病,AD具有多基因遺傳背景,且發(fā)病機制復(fù)雜。膽固醇代謝穩(wěn)態(tài)失調(diào)與認知功能障礙和AD有關(guān),膽固醇調(diào)節(jié)相關(guān)的遺傳變異也關(guān)聯(lián)認知功能障礙和AD風(fēng)險,然其機制依然不清。因此,在基因組和轉(zhuǎn)錄組水平開展AD病因?qū)W相關(guān)的系統(tǒng)研究將有助于探索AD的病因、生物標志物和致病機制,具有潛在的臨床實際應(yīng)用價值。目的:1、在中國AD人群中識別新的AD風(fēng)險相關(guān)膽固醇調(diào)節(jié)基因遺傳變異及驗證候選AD風(fēng)險相關(guān)基因變異并進行功能分析。2、在課題組前期研究基礎(chǔ)上開展膽固醇調(diào)節(jié)基因APOC1體外分子機制研究,初步探索AD潛在的致病機制。3、探索功能相關(guān)AD轉(zhuǎn)錄組水平差異表達譜。方法:1、在854例AD患者、1059例AD源性輕度認知功能障礙(MCI-AD)患者和1254例認知正常老年對照共計3167例樣本中,對12個膽固醇調(diào)節(jié)相關(guān)核受體基因和APOE共計13個基因進行靶向測序,篩選潛在變異并進行識別、驗證和初步功能分析。2、利用分子微陣列質(zhì)譜分型平臺...

【文章頁數(shù)】:136 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

圖3pGL3-promotor結(jié)構(gòu)示意圖

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北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博士學(xué)位論文重復(fù),測定吸光度(0D)值;??待AP40反應(yīng)孔顯色30min后,加入stop?solutionlOO^L于每空內(nèi),吹打混??Infinite?2000?pro?酶標儀測定?OD?值;??取梯度標準品OD值,利用Curve?expert?vl4.0軟件建....


圖8pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR結(jié)構(gòu)示意圖

圖8pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR結(jié)構(gòu)示意圖

用PLINK1.90對據(jù)進行質(zhì)后進行關(guān)聯(lián)分目標變異致病性分析。??固醇調(diào)節(jié)基因AP0C7體外研宄??課題組前期薈萃(meta)分析發(fā)現(xiàn),在東亞人群、高加索人群和西班牙裔人群醇調(diào)節(jié)基因APOCJ基因變異增加AD患病風(fēng)險發(fā)現(xiàn)n。同時,基于本課題組的AD隊列人群研究,JPOC7基因變異....


圖11慢病毒包裝流程??Figure?11?Flowchart?of?Lentivirus?packaging??

圖11慢病毒包裝流程??Figure?11?Flowchart?of?Lentivirus?packaging??

??包裝流程如圖11所示。將plenti6.3-EGFP-APOCl慢病毒載體和包裝質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染??HEK293T細胞獲得病毒顆粒,采用RT-qPCR法檢測靶基因RNA水平。??O?C?二>??鴒?1?〇??〇?'?w:????病毐&包裝質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染靶細胞收獲病毒顆粒濃縮滴度檢測??....


圖13鏈特異性RNA-seq數(shù)據(jù)分析流程圖??Figure?13?Bioinformatic?analysis?of?RNA-seq?data??1、mRNA分析??(1)原始測序數(shù)據(jù)(raw?data)分析和質(zhì)控??

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北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博士學(xué)位論文控??庫??序??、雜交及稀釋??ter)生成:將流動池(Flowcell)和準備好的文庫在cBot測序:將完成簇生成的流動池轉(zhuǎn)移到測序儀上,選擇正確據(jù)分析??所示,對測序得到的原始雙端序列進行質(zhì)控和過濾后,行比對,基于比對結(jié)果分別進行標準分析和高級分析....



本文編號:3953980

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