鴿皰疹病毒XY2019株的分離鑒定與UL30基因序列分析
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【部分圖文】:
圖1傳代后病毒PCR擴(kuò)增
對收獲的尿囊液、絨毛尿囊膜進(jìn)行病毒PCR擴(kuò)增,電泳結(jié)果表明從樣本中成功擴(kuò)增出了1326bp的目的條帶(圖1),證實(shí)病毒分離成功,命名為XY2019株。2.4UL30基因測序與分析結(jié)果
圖2UL30基因陽性質(zhì)粒酶切結(jié)果
回收UL30基因片段,連接pGEM-Teasy載體,構(gòu)建質(zhì)粒并酶切鑒定,結(jié)果顯示酶切片段大小符合預(yù)期結(jié)果(圖2)。鑒定正確的陽性質(zhì)粒測序后成功獲得了XY2019株1326bp長度的UL30基因片段,利用DNAStar軟件,將獲得序列與GenBank中已知參考序列比對,同源性....
圖3XY2019株UL30基因與參考序列同源性比較結(jié)果
鑒定正確的陽性質(zhì)粒測序后成功獲得了XY2019株1326bp長度的UL30基因片段,利用DNAStar軟件,將獲得序列與GenBank中已知參考序列比對,同源性結(jié)果見圖3,系統(tǒng)發(fā)生樹見圖4。圖4基于UL30基因構(gòu)建的基因進(jìn)化樹
圖4基于UL30基因構(gòu)建的基因進(jìn)化樹
圖3XY2019株UL30基因與參考序列同源性比較結(jié)果GenBank中PiHVUL30基因參考序列僅有4株,參考序列BJ株分離于中國北京市,登錄號KC544263,來源于鴿;HLJ株分離于中國黑龍江省,登錄號KX589235,來源于野鴿;S-18株分離于墨西哥,登錄號NC02....
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