PLA3基因生物信息學(xué)分析及在赤霉素調(diào)控水稻種子萌發(fā)中的作用
發(fā)布時(shí)間:2024-01-25 14:43
水稻(Oryza sativa) PLA3基因編碼谷氨酸羧肽酶,影響種子萌發(fā)等生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程。本研究運(yùn)用CRISPRCas9技術(shù)獲得‘日本晴’水稻pla3突變體,該突變體具有胚變大、易萌發(fā)的表型。通過(guò)對(duì)PLA3蛋白進(jìn)行多物種同源比對(duì)和進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)其具有較高的保守性。對(duì)PLA3基因的時(shí)空表達(dá)和響應(yīng)不同激素的表達(dá)進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)其在胚中表達(dá)較高,并受赤霉素(GA)等誘導(dǎo)。同時(shí)對(duì)PLA3蛋白的亞細(xì)胞定位、種子萌發(fā)過(guò)程中GA的含量及轉(zhuǎn)錄組學(xué)差異等進(jìn)行分析,結(jié)果表明:PLA3定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng);野生型與pla3種子萌發(fā)中不同階段(12和30 h)胚內(nèi)GA含量差異較大;轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選獲得與GA信號(hào)途徑相關(guān)的41個(gè)差異基因; pla3中信號(hào)途徑基因如GID2表達(dá)出現(xiàn)明顯上調(diào)。綜上所述, PLA3基因與種子萌發(fā)相關(guān)并參與GA調(diào)控種子萌發(fā)的過(guò)程。
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與試劑
1.2 生物信息學(xué)分析
1.3 PLA3亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)
1.4 用LC-MS/MS測(cè)定GA含量的方法
1.5 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 PLA3基因生物信息學(xué)相關(guān)分析
2.1.1 PLA3蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2.1.2 PLA3基因時(shí)空表達(dá)特異性分析
2.1.3 PLA3基因響應(yīng)植物激素的表達(dá)分析
2.1.4 PLA3蛋白亞細(xì)胞定位
2.2 PLA3對(duì)種子萌發(fā)的影響及其與GA的關(guān)系
2.2.1 PLA3對(duì)種子萌發(fā)的影響
2.2.2 野生型與pla3種子萌發(fā)過(guò)程中GA含量的差異比較
2.2.3 野生型與pla3種子萌發(fā)過(guò)程中轉(zhuǎn)錄組差異基因分析
3 討論
本文編號(hào):3885007
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1 材料與方法
1.1 材料與試劑
1.2 生物信息學(xué)分析
1.3 PLA3亞細(xì)胞定位實(shí)驗(yàn)
1.4 用LC-MS/MS測(cè)定GA含量的方法
1.5 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 PLA3基因生物信息學(xué)相關(guān)分析
2.1.1 PLA3蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
2.1.2 PLA3基因時(shí)空表達(dá)特異性分析
2.1.3 PLA3基因響應(yīng)植物激素的表達(dá)分析
2.1.4 PLA3蛋白亞細(xì)胞定位
2.2 PLA3對(duì)種子萌發(fā)的影響及其與GA的關(guān)系
2.2.1 PLA3對(duì)種子萌發(fā)的影響
2.2.2 野生型與pla3種子萌發(fā)過(guò)程中GA含量的差異比較
2.2.3 野生型與pla3種子萌發(fā)過(guò)程中轉(zhuǎn)錄組差異基因分析
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