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青峪豬生長發(fā)育規(guī)律和拐點期差異表達基因及最佳肉質性狀日齡研究

發(fā)布時間:2023-12-02 09:31
  青峪豬主要分布在四川盆地北部大巴山區(qū),是湖川山地豬在四川盆周山區(qū)的一個類群。青峪豬具有耐粗飼、適應性強,肉質好等特點,尤其以富含“雪花肉”而著稱。和很多地方豬品種一樣,青峪豬一直缺乏有效保護,生物學特性相關的基礎研究十分有限。為更好的保護這一獨特的品種資源,針對青峪豬的生長發(fā)育規(guī)律和不同生長階段的基因表達特性及肉質性狀差異開展了研究。首先,利用Gompertz、Logistic和Von Bertalanffy等3種非線性模型對青峪豬的體重和體尺生長規(guī)律進行非線性擬合,得到了相應的生長曲線。并通過殘差標準誤(RSE)、決定系數(shù)(R2)、校正系數(shù)R2(adj.R2)、赤池信息準則(AIC)和貝葉斯信息準則(BIC)等評估各模型的最優(yōu)擬合度,確定體重和體尺的最佳數(shù)學模型,并計算相應的最大生長速度拐點(MGR)、“慢增期—快增期”拐點(GRI)和“快增期—緩增期”拐點(RSI)等重要生理參數(shù)。再建立混合效應模型進一步探究體重和體尺的基本生長發(fā)育規(guī)律。選取3個拐點(MGR,GRI和RSI)肌肉樣品進行轉錄組測序(RNA-seq),...

【文章頁數(shù)】:78 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞
1 文獻綜述
    1.1 青峪豬概述
        1.1.1 品種簡介
        1.1.2 生產(chǎn)性能
    1.2 生長曲線擬合
        1.2.1 動物生長發(fā)育規(guī)律
        1.2.2 生長曲線模型
        1.2.3 生長曲線應用
    1.3 生長拐點和生長相關基因
        1.3.1 生長曲線拐點研究
        1.3.2 生長相關基因
    1.4 豬肉質性狀
        1.4.1 影響因素
        1.4.2 測定指標
    1.5 生長發(fā)育與肉質性能
    1.6 研究目的及意義
2 材料與方法
    2.1 主要儀器和試劑
    2.2 生長曲線擬合
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 生長曲線擬合
    2.3 轉錄組測序和分析
        2.3.1 樣品采集
        2.3.2 RNA提取
        2.3.3 測序和分析
    2.4 屠宰測定和主成分分析
        2.4.1 屠宰群體
        2.4.2 測定指標
        2.4.3 主成分分析
    2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
3 結果與分析
    3.1 生長曲線擬合
    3.2 青峪豬生長發(fā)育規(guī)律
        3.2.1 體尺生長發(fā)育規(guī)律
        3.2.2 體重和體尺生長發(fā)育的相關性
        3.2.3 體重生長發(fā)育的影響因素
    3.3 生長拐點期基因表達差異的研究
        3.3.1 三個拐點轉錄組差異比較
        3.3.2 不同階段差異基因GO和 Pathway富集分析
    3.4 不同屠宰日齡胴體和肉質性狀研究
        3.4.1 不同屠宰日齡胴體性狀研究
        3.4.2 不同屠宰日齡肉質性狀研究
        3.4.3 不同屠宰日齡肉質性能主成分分析
4 討論
    4.1 青峪豬最優(yōu)生長曲線
    4.2 青峪豬體重和體尺生長發(fā)育
    4.3 青峪豬體重的影響因素
    4.4 生長拐點基因差異表達研究
    4.5 不同日齡的胴體和肉質的研究
5 結論
參考文獻
致謝
附錄
作者簡歷



本文編號:3869391

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