基于線粒體COI基因的雷州半島馬尾藻屬常見(jiàn)種DNA條形碼鑒定及系統(tǒng)進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2023-06-03 19:38
采用DNA條形碼技術(shù)輔以傳統(tǒng)形態(tài)分類方法,對(duì)雷州半島馬尾藻屬(Sargassum)6常見(jiàn)種進(jìn)行物種鑒定和系統(tǒng)進(jìn)化分析。測(cè)得6種馬尾藻線粒體COI基因序列,該序列與Gen Bank和BOLD數(shù)據(jù)庫(kù)中馬尾藻序列同源性均大于或等于99%,該結(jié)果與形態(tài)分類學(xué)鑒定結(jié)果一致。COI基因序列特征分析表明,6種馬尾藻保守位點(diǎn)421個(gè),變異位點(diǎn)58個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)21個(gè),單一突變位點(diǎn)37個(gè),變異率7.7%,T、C、A、G平均含量分別為39.1%、18.9%、19.1%、22.9%,A+T含量(58.2%)高于C+G含量(41.8%),UUU所編碼的苯丙氨酸(F)使用頻率最高,達(dá)12.5%,最大似然法估算的轉(zhuǎn)換顛換比值為2.42,種間遺傳距離多在0.030±0.0130.100±0.016之間。聚類分析結(jié)果與形態(tài)學(xué)鑒定、同源性分析結(jié)果一致。
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料采集
1.2 形態(tài)學(xué)分類
1.3 分子生物學(xué)鑒定
1.3.1 基因組DNA提取
1.3.2 mt DNA-COI序列PCR擴(kuò)增與測(cè)序
1.3.3 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 形態(tài)學(xué)分類與分子鑒定
2.2 線粒體COI基因片段序列特征分析
2.3 遺傳距離
2.4 聚類分析
3 討論
本文編號(hào):3829916
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1 材料與方法
1.1 材料采集
1.2 形態(tài)學(xué)分類
1.3 分子生物學(xué)鑒定
1.3.1 基因組DNA提取
1.3.2 mt DNA-COI序列PCR擴(kuò)增與測(cè)序
1.3.3 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 形態(tài)學(xué)分類與分子鑒定
2.2 線粒體COI基因片段序列特征分析
2.3 遺傳距離
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