【目的】明確木薯不同性型花的轉(zhuǎn)錄組差異,為深入研究木薯多開雌花和兩性花及協(xié)調(diào)木薯性別比例提供理論參考。【方法】以木薯雄蕾、雌蕾和兩性蕾為供試材料,采用Illumina HiSeqTM4000測序平臺對其進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,通過生物信息學(xué)對轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行比較分析,預(yù)測和篩選出木薯性別決定相關(guān)基因�！窘Y(jié)果】通過轉(zhuǎn)錄組分析獲得高質(zhì)量序列(Clean reads)64189053個,高質(zhì)量堿基19.29 Gb。3種花蕾的GC含量均在43.00%左右、Q30均在95.00%左右。木薯雄蕾、雌蕾和兩性蕾的Clean reads總數(shù)分別為42642272、42172402和43563432條,其中,參考基因組和單端的比對率均在77.00%左右、多位置比對率均小于0.80%,正、負(fù)鏈比對率均在39.00%左右;約有90.00%的序列定位于外顯子,僅有5.00%的序列定位于內(nèi)含子或基因間區(qū)。在雄蕾—雌蕾(前者是對照,后者是處理,下同)、雄蕾—兩性蕾和雌蕾—兩性蕾3個對比組中分別篩選到3629、2499和2492個差異表達(dá)基因(DEGs),注釋到GO功能數(shù)據(jù)庫中的DEGs分別為2544、1749和1807個,其中...

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 樣品采集
    1.3 RNA提取、文庫構(gòu)建及測序
    1.4 數(shù)據(jù)分析
    1.5 差異表達(dá)基因（DEGs）篩選
    1.6 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 木薯花蕾測序數(shù)據(jù)及質(zhì)量分析結(jié)果
    2.2 木薯不同花蕾間的DEGs分析結(jié)果
        2.2.1 DEGs的GO功能富集分析結(jié)果
        2.2.2 DEGs的KEGG信號通路富集分析結(jié)果
        2.2.3 DEGs的COG功能注釋分析結(jié)果
    2.3 木薯性別決定關(guān)鍵基因篩選結(jié)果
        2.3.1 不同花性型激素相關(guān)且差異表達(dá)顯著基因分析結(jié)果
        2.3.2 不同花性型差異表達(dá)顯著轉(zhuǎn)錄因子基因分析結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論



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