花鱸b2m基因cDNA的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-05-04 04:19
為探究花鱸(Lateolabrax maculatus) b2m (Beta-2 microglobulin)基因?qū)?xì)菌和病毒感染的響應(yīng),該研究通過(guò)RACE-PCR擴(kuò)增獲得了花鱸b2m基因,該基因cDNA全長(zhǎng)為1 383 bp,開(kāi)放閱讀框(Open reading frame, ORF)為357 bp,編碼118個(gè)氨基酸。所推測(cè)的編碼蛋白與已報(bào)道的魚(yú)類B2m的氨基酸序列相似度為44.8%~63.2%。基因共線性分析顯示,b2m基因座位置在魚(yú)類基因組中高度保守。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)花鱸b2m基因在各組織器官中的分布,結(jié)果表明花鱸b2m在所檢測(cè)組織器官中均有表達(dá),脾臟中表達(dá)量最高,鰓、頭腎和腦中次之。通過(guò)腹腔注射脂多糖(Lipopolysaccharide, LPS)、聚肌苷-脫氧胞苷酸(Poly I:C)和遲緩愛(ài)德華氏菌(Edwardsiella tarda, Edw)研究花鱸感染后b2m的表達(dá)變化,結(jié)果顯示3種刺激物均可誘導(dǎo)花鱸b2m在鰓、腸、頭腎、脾臟組織中表達(dá)上調(diào),推測(cè)b2m基因參與了花鱸抗細(xì)菌、抗病毒感染的免疫應(yīng)答過(guò)程。
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 總RNA提取與cDNA合成
1.2 花鱸b2m cDNA全長(zhǎng)序列的擴(kuò)增
1.3 生物信息學(xué)分析
1.4 b2m基因的表達(dá)模式分析
1.5 Poly (I:C)、LPS及遲緩愛(ài)德華氏菌人工感染對(duì)花鱸b2m表達(dá)的調(diào)節(jié)
2 結(jié)果
2.1 花鱸b2m的cDNA序列特征
2.2 氨基酸序列比對(duì)和分子系統(tǒng)發(fā)育分析
2.3 B2m三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)
2.4 b2m基因結(jié)構(gòu)及共線性分析
2.5 花鱸b2m基因的組織表達(dá)模式分析
2.6 花鱸腹腔注射LPS、Poly (I:C)和Edw其b2m基因的表達(dá)狀況
3討論
本文編號(hào):3807935
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1 材料與方法
1.1 總RNA提取與cDNA合成
1.2 花鱸b2m cDNA全長(zhǎng)序列的擴(kuò)增
1.3 生物信息學(xué)分析
1.4 b2m基因的表達(dá)模式分析
1.5 Poly (I:C)、LPS及遲緩愛(ài)德華氏菌人工感染對(duì)花鱸b2m表達(dá)的調(diào)節(jié)
2 結(jié)果
2.1 花鱸b2m的cDNA序列特征
2.2 氨基酸序列比對(duì)和分子系統(tǒng)發(fā)育分析
2.3 B2m三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)
2.4 b2m基因結(jié)構(gòu)及共線性分析
2.5 花鱸b2m基因的組織表達(dá)模式分析
2.6 花鱸腹腔注射LPS、Poly (I:C)和Edw其b2m基因的表達(dá)狀況
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