發(fā)布時間：2023-04-09 02:25

　　【目的】分析黃瓜基因組中與葉酸合成代謝相關(guān)的基因數(shù)量、定位以及表達特征,對關(guān)鍵酶基因進行生物信息學(xué)分析與克隆,旨在為黃瓜葉酸合成調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)�！痉椒ā扛鶕�(jù)已報道的擬南芥葉酸合成相關(guān)基因,利用黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫中9930_V3版本進行BLAST比對。利用MapChart繪制黃瓜染色體物理圖譜并對基因定位。利用qRT-PCR分析這些基因在黃瓜果實發(fā)育不同時期和不同材料中的表達量。通過MEGA、WebLOGO、ExPASy等工具對關(guān)鍵酶基因進行生物信息學(xué)分析。通過PCR擴增對關(guān)鍵酶基因進行克隆,并測序分析基因的序列差異�！窘Y(jié)果】同源比對獲得19個黃瓜葉酸代謝相關(guān)基因,這些基因不均勻分布在黃瓜7條染色體上,且以Chr.4和Chr.5上分布最多。通過對其中11個調(diào)控葉酸合成的基因在測序黃瓜9930果實發(fā)育不同時期以及果實葉酸含量高低差異顯著的2份材料的表達量分析,發(fā)現(xiàn)CsFPGS、CsHPPK/CsDHPS和CsDHNA 3個基因與果實葉酸含量變化趨勢完全一致;CsADCS、CsADCL、CsDHNA、CsHPPK/CsDHFS、CsFPGS、CsDHFS等基因的表達量在2...

【文章頁數(shù)】：17 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 試驗方法
        1.2.1 黃瓜葉酸合成代謝相關(guān)基因鑒定
        1.2.2 黃瓜材料取樣方式及葉酸含量測定
        1.2.3 總RNA的提取與cDNA第一鏈的合成
        1.2.4 黃瓜葉酸合成基因在果實發(fā)育不同時期及不同材料中的表達量分析
        1.2.5 黃瓜葉酸合成關(guān)鍵酶基因的蛋白序列比對及系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
        1.2.6 黃瓜GCHI及ADCS的克隆與序列分析
        1.2.7 基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 黃瓜葉酸合成相關(guān)基因
    2.2 基因的染色體定位
    2.3 9930果實發(fā)育不同時期葉酸含量及對應(yīng)時期的葉酸合成基因的表達量
    2.4 果實葉酸含量高低差異顯著材料65G和02245中基因的表達量分析
    2.5 黃瓜及其他物種GCHI蛋白質(zhì)序列分析及進化樹構(gòu)建
    2.6 黃瓜及其他物種ADCS蛋白質(zhì)序列分析及進化樹構(gòu)建
    2.7 黃瓜GCHI與ADCS基因全長的克隆與序列分析
    2.8 黃瓜GCHI與ADCS基因的生物信息學(xué)分析
3 討論
4 結(jié)論



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