秀珍菇(Pleurotus pulmonarius)屬于變溫結實菇種,低溫刺激可誘導其子實體形成。為了探究秀珍菇結實的分子機制,本實驗采用Illumina測序技術,對發(fā)菌完好的秀珍菇菌包的菌絲體常溫培養(yǎng)階段、低溫誘導階段、低溫誘導后恢復至常溫階段、原基形成階段4個不同生長發(fā)育階段進行了全轉錄組測序,構建了4個樣本的c DNA文庫,并檢測文庫質量;利用Trinity軟件拼接得到的轉錄組作為參考序列將4個樣本的clean reads與之進行比對(mapping);最后對獲得的有效序列進行功能注釋及相關生物信息學分析。在4個不同生長階段分別得到41 544 496、45 722 382、46 642 306和49 980 456個高質量測序標簽。將所有高質量測序標簽與參考序列進行比對定位,可以唯一定位到參考序列上的高質量標簽數分別占總數的83.22%、82.85%、83.10%和82.59%�；虿町惐磉_分析顯示,與常溫狀態(tài)下相比,低溫處理后秀珍菇菌絲體中上調表達基因個數為1 216個,下調表達基因的個數為1 046個;同時,與低溫誘導后恢復至常溫相比,原基形成階段秀珍菇上調表達基因個數為1...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實驗材料
    1.2 主要試劑及儀器
    1.3 RNA提取
    1.4 測序
    1.5 參考序列比對
    1.6 基因差異表達分析
    1.7 GO功能富集分析
    1.8 KEGG通路(Pathway)顯著性富集分析
    1.9 差異表達基因的q RT-PCR驗證
2 結果與分析
    2.1 RNA提取
    2.2 參考序列比對
    2.3 樣本間差異表達分析
    2.4 原基特異性表達基因分析
    2.5 GO功能富集分析
    2.6 通路顯著性富集分析
    2.7 差異表達基因的q RT-PCR驗證
3 討論
4 結論



本文編號：3759085