鹽脅迫下蠶豆萌發(fā)期轉錄組及LEA基因家族分析
發(fā)布時間:2023-03-06 13:12
蠶豆(Vicia faba L.)是一種重要的食用豆類作物。由于蠶豆種子萌發(fā)期對鹽分較為敏感,同時萌發(fā)期又是植物整個生長過程的起始,使得土壤中鹽分的累積嚴重限制了蠶豆的生產。因此提高在種子萌發(fā)階段的耐鹽性,是蠶豆育種的最佳改良策略。為了研究鹽脅迫下種子萌發(fā)階段的基因動態(tài)表達,使用RNA-seq方法研究了兩種在萌發(fā)期具有不同耐鹽性的蠶豆品種的全基因組轉錄譜。通過比較耐鹽性品種Y134和鹽度敏感型品種Y078的基因表達差異,共鑒定出4486個差異基因(DEG)。其中,有1410個候選DEG被鑒定為鹽脅迫反應基因。此外,在鹽處理下16和24小時的種子發(fā)芽過程中,有623個DEG被鑒定為品種特異性應答基因。這些DEG中一些參與細胞壁的松動(例如,木葡聚糖內切葡糖苷酶/水解酶,幾丁質酶和彈性蛋白),激素代謝(例如,LEA基因,與ABA或乙烯信號通路相關的基因),染色質重塑(例如,染色質結構蛋白,LHP1)等在鹽處理的耐鹽品種中顯著上調,表明它們在鹽脅迫下種子萌發(fā)調控中起關鍵作用。結果表明,大量基因可調節(jié)蠶豆對鹽分的響應,其調控機制較為復雜。根據鹽脅迫下蠶豆種子萌發(fā)期的轉錄組(RNA-seq)數(shù)據...
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
1.1 鹽脅迫研究現(xiàn)狀及響應機制
1.2 種子萌發(fā)
1.3 種子萌發(fā)調控
1.4 鹽脅迫下種子萌發(fā)期研究進展
1.5 蠶豆鹽脅迫研究進展
1.6 轉錄組技術的應用
1.7 LEA蛋白研究進展
1.8 研究的目的和意義
第二章 轉錄組分析
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.3 結果與分析
2.4 討論
第三章 基于蠶豆轉錄組數(shù)據的LEA基因家族分析
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.3 結果與分析
3.4 討論
第四章 全文結論
致謝
參考文獻
附表
個人簡介
本文編號:3757050
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
1.1 鹽脅迫研究現(xiàn)狀及響應機制
1.2 種子萌發(fā)
1.3 種子萌發(fā)調控
1.4 鹽脅迫下種子萌發(fā)期研究進展
1.5 蠶豆鹽脅迫研究進展
1.6 轉錄組技術的應用
1.7 LEA蛋白研究進展
1.8 研究的目的和意義
第二章 轉錄組分析
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.3 結果與分析
2.4 討論
第三章 基于蠶豆轉錄組數(shù)據的LEA基因家族分析
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.3 結果與分析
3.4 討論
第四章 全文結論
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