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青海地區(qū)藏、漢族胃癌差異表達基因的篩選研究

發(fā)布時間:2022-09-27 19:51
  目的:以青海地區(qū)藏族和漢族胃癌血漿、組織標(biāo)本為研究對象,采用mi RNA芯片等相關(guān)檢測方法,分析青海地區(qū)藏、漢族胃癌發(fā)生發(fā)展過程中的基因表達差異。方法:收集2017年10月-2019年03月在青海省人民醫(yī)院行手術(shù)治療胃癌患者胃癌、癌旁組織及術(shù)前靜脈血各80例,同時收集健康者靜脈血10例(其中藏族5例,漢族5例),并采集臨床資料。從75例胃癌手術(shù)患者中隨機選取5例藏族、5例漢族胃癌患者胃癌組織、術(shù)前血漿作為病例組進行mi RNA芯片檢測,5例藏族、5例漢族健康者靜脈血血漿為對照組進行mi RNA芯片檢測,篩選出差異表達的mi RNA并通過相關(guān)軟件預(yù)測差異mi RNA可能的靶基因,并對這些靶基因進行聚類分析、基因功能及信號通路分析。結(jié)果:1.通過基因芯片檢測及進一步篩選得到了235個可能有意義的差異mi RNA,其中表達上調(diào)的118個,下調(diào)的117個(P<0.05且FC≥2)。2.通過12種數(shù)據(jù)庫預(yù)測得到差異mi RNA可能的靶基因,以及靶基因可能的功能、靶基因可能富集到的一些信號通路。3.根據(jù)P值及FC值從每組篩選出10個差異mi RNA共40個差異mi RNA準(zhǔn)備進行下一步驗證。結(jié)論:... 

【文章頁數(shù)】:63 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號對照表
第一章 引言
第二章 材料與方法
    2.1 研究對象
    2.2 實驗材料
        2.2.1 主要試劑
        2.2.2 主要儀器及設(shè)備
    2.3 資料收集
    2.4 實驗方法
        2.4.1 標(biāo)本采集及保存
        2.4.2 血漿樣本實驗步驟
        2.4.3 組織樣本實驗步驟
    2.5 生物信息學(xué)研究
        2.5.1 聚類分析
        2.5.2 差異miRNA靶基因預(yù)測
        2.5.3 差異miRNA靶基因功能分析(Gene Ontology,GO)和信號通路分析(Pathway)
    2.6 統(tǒng)計學(xué)分析
第三章 結(jié)果
    3.1 一般臨床特征
    3.2 RNA質(zhì)量控制
    3.3 芯片檢測得到的差異miRNA
        3.3.1 血漿樣本中差異miRNA數(shù)量統(tǒng)計
        3.3.2 組織樣本中差異miRNA數(shù)量統(tǒng)計
    3.4 差異miRNA的靶基因富集分析
        3.4.1 漢族胃癌血漿與對照血漿組GO和 Pathway分析
        3.4.2 藏族胃癌血漿與對照血漿組GO和 Pathway分析
        3.4.3 漢族胃癌組織與癌旁組織組GO和 Pathway分析
        3.4.4 藏族胃癌組織與癌旁組織組GO和 Pathway分析
    3.5 篩選出的待驗證差異miRNA
第四章 討論
    4.1 胃癌發(fā)病及預(yù)后現(xiàn)狀
    4.2 芯片檢測得到的差異miRNA
    4.3 待驗證的差異miRNA
        4.3.1 漢族胃癌血漿與正常血漿實驗組
        4.3.2 漢族胃癌組織與癌旁組織實驗組
        4.3.3 藏族胃癌血漿與正常血漿實驗組
        4.3.4 藏族胃癌組織與癌旁組織實驗組
    4.4 本研究的優(yōu)勢與局限
第五章 結(jié)論
參考文獻
致謝
綜述 miRNA在胃癌診療中的研究進展
    參考文獻
作者簡歷


【參考文獻】:
期刊論文
[1]MicroRNAs在腫瘤相關(guān)成纖維細胞促進腫瘤發(fā)展進程中的作用[J]. 郭雪茹,徐克.  中國腫瘤生物治療雜志. 2019(11)
[2]miRNAs在高級別漿液性卵巢癌中的作用[J]. 熊嬌,李娜,王東紅.  醫(yī)學(xué)綜述. 2019(22)
[3]miRNA與動脈粥樣硬化炎癥機制研究進展[J]. 顧燕妮,謝春毅.  中國免疫學(xué)雜志. 2019(20)
[4]藥物性肝損傷與非編碼RNA的研究進展[J]. 盧西雅,王菲,楊長青.  國際消化病雜志. 2019(05)
[5]microRNA集合富集分析工具的研究進展[J]. 李建偉,徐夢夢,楊宵月,劉磊波,杜燕波,韓小芬.  生理科學(xué)進展. 2019(05)
[6]微小RNA在心臟傳導(dǎo)系統(tǒng)中的研究現(xiàn)狀[J]. 朱煙朦,謝冰鑫,孫麗華.  中國臨床藥理學(xué)雜志. 2019(19)
[7]MicroRNA-320a suppresses tumor progression by targeting PBX3 in gastric cancer and is downregulated by DNA methylation[J]. Yong-Shuang Li,Ying Zou,Dong-Qiu Dai.  World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2019(10)
[8]miR-335、Survivin表達及對乳腺癌術(shù)后患者預(yù)后評估的價值[J]. 余進松,李忠,徐毅,李淵,賈韻豪,丁波.  現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2019(13)
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[10]miRNA調(diào)控腫瘤微環(huán)境的研究進展[J]. 李欣,羅小玲.  現(xiàn)代免疫學(xué). 2019(03)

碩士論文
[1]胃腺癌腫瘤干細胞中異常表達的miRNA初篩及miR-199b-5p的初步研究[D]. 曹陽.河北大學(xué) 2017



本文編號:3681514

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