Dof（DNA-binding one zinc finger）蛋白是一類植物所特有的轉(zhuǎn)錄因子,N-末端具有高度保守的C₂-C₂單鋅指結(jié)構(gòu)域,C-末端的轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)的氨基酸具有高度多樣性,其在植物光合、細(xì)胞周期及逆境響應(yīng)等過程中發(fā)揮著重要的作用。本研究基于金銀花測序數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)的方法篩選了候選的LjDof基因,并對其理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、同源序列比對、保守基序、系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育和表達(dá)模式進(jìn)行了深入分析。結(jié)果表明,金銀花Dof轉(zhuǎn)錄因子家族包含11個基因,編碼的氨基酸的個數(shù)為157～492,理論等電點為5.45～9.48,均為不穩(wěn)定親水性蛋白。亞細(xì)胞定位顯示,LjDof基因都在細(xì)胞核中有定位,個別在其他部位也有定位。同源比對和Motif分析發(fā)現(xiàn),11個LjDof基因都含有完整的C₂-C₂單鋅指結(jié)構(gòu)。系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育分析表明,金銀花Dof蛋白分為五個亞類。實時熒光定量PCR及表達(dá)模式分析表明,LjDof基因在金銀花低溫脅迫不同時間下有著不同的表達(dá)規(guī)律。本研究結(jié)果為進(jìn)一步研究金銀花Dof基因在逆境脅迫下的功能... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 金銀花Dof基因家族的篩選及序列分析
    1.2 金銀花Dof家族蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測
    1.3 金銀花Dof家族蛋白同源比對及保守結(jié)構(gòu)域(Motif)分析
    1.4 金銀花Dof家族蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析
    1.5 金銀花Dof基因在低溫下的表達(dá)特征分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 金銀花Dof基因家族蛋白理化性質(zhì)分析
    2.2 金銀花Dof蛋白家族基因亞細(xì)胞定位預(yù)測
    2.3 金銀花Dof蛋白保守結(jié)構(gòu)域分析
    2.4 金銀花Dof蛋白Motif分析
    2.5 Dof家族蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析
    2.6 金銀花Dof基因家族在低溫脅迫下的表達(dá)分析
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]茶樹兩個Dof轉(zhuǎn)錄因子的分離及其在溫度脅迫中的響應(yīng)分析[J]. 李輝,黃蔚,劉志薇,王永鑫,吳致君,莊靜.  茶葉科學(xué). 2016(03)
[2]植物Dof轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)特點及功能研究進(jìn)展[J]. 張雪,尹悅佳,范貝,李慧杰,費(fèi)小鈺,崔喜艷.  作物雜志. 2016(02)
[3]轉(zhuǎn)GmDof11基因高油轉(zhuǎn)基因大豆的鑒定及主要農(nóng)藝性狀調(diào)查[J]. 王志坤,Arun Sebastian,常健敏,李丹丹,邱波,張大勇,李文濱.  作物雜志. 2014(02)
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本文編號：3680671