甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-1和BoYgl-2的精細(xì)定位及候選基因分析
發(fā)布時(shí)間:2022-08-09 16:21
結(jié)球甘藍(lán)(Brassica oleracea L.var.capitata)簡(jiǎn)稱甘藍(lán),是一種重要的十字花科蕓薹屬蔬菜。甘藍(lán)葉色通常為綠色,YL-1和4036Y是本課題組發(fā)現(xiàn)的兩個(gè)黃綠葉色突變體。本研究對(duì)兩個(gè)突變體進(jìn)行了遺傳規(guī)律分析及基因精細(xì)定位,完成了兩個(gè)候選基因的變異分析,為揭示黃綠葉色形成機(jī)理、促進(jìn)甘藍(lán)葉色育種奠定了基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.在YL-1的C01染色體重組抑制區(qū)段精細(xì)定位了BoYgl-1基因,揭示了該區(qū)段發(fā)生一個(gè)6.3 Mb的倒位,候選基因Bo1g078470和Bo1g078800在YL-1中啟動(dòng)子區(qū)域或編碼區(qū)存在變異。以黃綠葉色甘藍(lán)突變體YL-1和正常綠葉芥藍(lán)自交系11-192為親本,構(gòu)建BC3-BC5分離群體,最終將BoYgl-1黃綠葉色基因定位于C01染色體392 Kb的區(qū)間。同時(shí)發(fā)現(xiàn)YL-1在標(biāo)記B4-4和T1-49之間發(fā)生了一個(gè)6.3 Mb的染色體倒位,導(dǎo)致該區(qū)段嚴(yán)重的重組抑制。定位區(qū)間內(nèi)共包含32個(gè)基因,其中Bo1g078470編碼CLPC2/HSP93-Ⅲ蛋白,調(diào)控葉綠體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn);Bo1g078800編碼一種PPR五肽重復(fù)蛋白,參與線粒體和葉綠體的RN...
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號(hào)對(duì)照表
第一章 緒論
1.1 葉色突變體研究進(jìn)展
1.1.1 葉色突變體的來源
1.1.2 葉色突變體的分類
1.1.3 葉色突變體的遺傳規(guī)律
1.1.4 葉色基因的定位及克隆
1.1.5 葉色突變體的分子機(jī)制
1.2 圖位克隆技術(shù)
1.2.1 圖位克隆的原理
1.2.2 圖位克隆的應(yīng)用及不足
1.3 BSA-seq技術(shù)
1.3.1 BSA-seq的原理
1.3.2 BSA-seq技術(shù)的應(yīng)用
1.4 目的意義
第二章 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-1的精細(xì)定位及候選基因分析
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 InDel標(biāo)記開發(fā)篩選
2.1.3 DNA提取
2.1.4 PCR擴(kuò)增及電泳
2.1.5 構(gòu)建遺傳圖譜
2.1.6 RNA提取及cDNA的合成
2.1.7 熒光定量PCR測(cè)定基因表達(dá)量
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 BoYgl-1基因的精細(xì)定位
2.2.2 YL-1在定位區(qū)間內(nèi)染色體倒位的確定
2.2.3 候選基因預(yù)測(cè)
2.2.4 候選基因表達(dá)水平分析
2.2.5 候選基因序列分析
2.3 討論
2.3.1 BoYgl-1基因精細(xì)定位分析
2.3.2 染色體倒位導(dǎo)致嚴(yán)重的重組抑制
2.3.3 YL-1染色體倒位邊界位置分析
第三章 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-2的遺傳分析及精細(xì)定位
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 表型調(diào)查及集群分離分析法(BSA)混池測(cè)序
3.1.3 InDel標(biāo)記開發(fā)篩選
3.1.4 DNA提取、PCR擴(kuò)增及電泳
3.1.5 遺傳圖譜的構(gòu)建
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 突變體4036Y葉色遺傳規(guī)律分析
3.2.2 兩個(gè)不同基因控制4036Y與YL-1葉色黃綠突變的遺傳學(xué)驗(yàn)證
3.2.3 利用BSA-seq初步定位BoYgl-2基因
3.2.4 BoYgl-2基因的精細(xì)定位
3.2.5 候選基因預(yù)測(cè)
3.2.6 候選基因分析
3.3 討論
3.3.1 BoYgl-2與BoYgl-1編碼不同的PPR蛋白
3.3.2 RNA-seq分析4036Y染色體片段缺失
第四章 結(jié)論
4.1 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-1的精細(xì)定位及候選基因分析
4.2 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-2的遺傳分析及精細(xì)定位
參考文獻(xiàn)
附錄A
附錄B
致謝
作者簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3672885
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號(hào)對(duì)照表
第一章 緒論
1.1 葉色突變體研究進(jìn)展
1.1.1 葉色突變體的來源
1.1.2 葉色突變體的分類
1.1.3 葉色突變體的遺傳規(guī)律
1.1.4 葉色基因的定位及克隆
1.1.5 葉色突變體的分子機(jī)制
1.2 圖位克隆技術(shù)
1.2.1 圖位克隆的原理
1.2.2 圖位克隆的應(yīng)用及不足
1.3 BSA-seq技術(shù)
1.3.1 BSA-seq的原理
1.3.2 BSA-seq技術(shù)的應(yīng)用
1.4 目的意義
第二章 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-1的精細(xì)定位及候選基因分析
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 InDel標(biāo)記開發(fā)篩選
2.1.3 DNA提取
2.1.4 PCR擴(kuò)增及電泳
2.1.5 構(gòu)建遺傳圖譜
2.1.6 RNA提取及cDNA的合成
2.1.7 熒光定量PCR測(cè)定基因表達(dá)量
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 BoYgl-1基因的精細(xì)定位
2.2.2 YL-1在定位區(qū)間內(nèi)染色體倒位的確定
2.2.3 候選基因預(yù)測(cè)
2.2.4 候選基因表達(dá)水平分析
2.2.5 候選基因序列分析
2.3 討論
2.3.1 BoYgl-1基因精細(xì)定位分析
2.3.2 染色體倒位導(dǎo)致嚴(yán)重的重組抑制
2.3.3 YL-1染色體倒位邊界位置分析
第三章 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-2的遺傳分析及精細(xì)定位
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 表型調(diào)查及集群分離分析法(BSA)混池測(cè)序
3.1.3 InDel標(biāo)記開發(fā)篩選
3.1.4 DNA提取、PCR擴(kuò)增及電泳
3.1.5 遺傳圖譜的構(gòu)建
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 突變體4036Y葉色遺傳規(guī)律分析
3.2.2 兩個(gè)不同基因控制4036Y與YL-1葉色黃綠突變的遺傳學(xué)驗(yàn)證
3.2.3 利用BSA-seq初步定位BoYgl-2基因
3.2.4 BoYgl-2基因的精細(xì)定位
3.2.5 候選基因預(yù)測(cè)
3.2.6 候選基因分析
3.3 討論
3.3.1 BoYgl-2與BoYgl-1編碼不同的PPR蛋白
3.3.2 RNA-seq分析4036Y染色體片段缺失
第四章 結(jié)論
4.1 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-1的精細(xì)定位及候選基因分析
4.2 甘藍(lán)黃綠葉色基因BoYgl-2的遺傳分析及精細(xì)定位
參考文獻(xiàn)
附錄A
附錄B
致謝
作者簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3672885
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