研究目的mTOR復(fù)合物（mTORC1和mTORC2）中基因的單核苷酸多態(tài)性與胃惡性腫瘤的遺傳易感性的關(guān)系。研究方法通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)評(píng)估m(xù)TOR復(fù)合物（mTORC1和mTORC2）中的9個(gè)候選基因的單核苷酸多態(tài)性（SNPs）與胃癌風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,并采用logistic回歸模型計(jì)算SNPs對(duì)胃癌易感性的相關(guān)性。結(jié)合表達(dá)量性狀位點(diǎn)（eQTL）分析,篩選出候選SNP。通過(guò)不同的模型分層分析候選SNP在不同亞組中胃癌風(fēng)險(xiǎn)之間的相關(guān)性。在PubMed、萬(wàn)方數(shù)據(jù)、中國(guó)知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(kù)、維普數(shù)據(jù)庫(kù)上搜索關(guān)于候選靶基因與消化道腫瘤的有關(guān)文獻(xiàn),并使用STATA12.0等軟件進(jìn)行Meta分析,評(píng)估候選靶基因表達(dá)量與消化道腫瘤臨床及預(yù)后的關(guān)聯(lián)性,通過(guò)下載公共數(shù)據(jù)庫(kù)TCGA（The Cancer Genome Atlas）中數(shù)據(jù),分析候選靶基因在胃癌中表達(dá)水平以及與胃癌臨床及預(yù)后的關(guān)系,并在GEO（Gene Expression Omnibus）數(shù)據(jù)庫(kù)中驗(yàn)證靶基因在胃癌中表達(dá)情況。采用雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn),探討靶結(jié)合區(qū)域SNP的生物學(xué)功能。研究結(jié)果通過(guò)使用全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)評(píng)估... 

【文章頁(yè)數(shù)】：66 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
中英文主要縮略詞對(duì)照
緒論
    1.1 胃癌的流行病學(xué)
    1.2 胃癌的發(fā)病因素與機(jī)制研究
    1.3 GWAS數(shù)據(jù)庫(kù)概述及在胃癌中的應(yīng)用
    1.4 mTOR復(fù)合體的概述
    1.5 研究方法及目的
第二章 基于GWAS數(shù)據(jù)庫(kù)篩選mTOR復(fù)合體中與胃癌相關(guān)SNPs
    2.1 研究對(duì)象
    2.2 選點(diǎn)策略
    2.3 候選SNP與胃癌相關(guān)性的分層分析
    2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
    2.5 結(jié)果
        2.5.1 mTOC1/2 復(fù)合物的候選基因確定
        2.5.2 候選SNPs的篩選與確定
        2.5.3 候選SNPs的功能性研究
        2.5.4 候選SNP在 GTEx數(shù)據(jù)集中驗(yàn)證
        2.5.5 rs4871819 與胃癌相關(guān)性的分層分析
    2.6 討論
第三章 DEPTOR在消化道腫瘤中的薈萃分析
    3.1 資料的搜集與納入
    3.2 數(shù)據(jù)整理與質(zhì)量評(píng)估
    3.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
    3.4 結(jié)果
        3.4.1 DEPTOR表達(dá)與消化道腫瘤患者LNM,臨床分期相關(guān)性分析
        3.4.2 DEPTOR表達(dá)與消化道腫瘤患者預(yù)后相關(guān)性分析
    3.5 討論
第四章 DEPTOR的表達(dá)與胃癌的相關(guān)性研究
    4.1 公共數(shù)據(jù)庫(kù)下載和使用
        4.1.1 TCGA(The Cancer Genome Atlas)數(shù)據(jù)庫(kù)使用
        4.1.2 GEO(Gene Expression Omnibus)數(shù)據(jù)庫(kù)使用
    4.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
    4.3 結(jié)果
        4.3.1 DEPTOR在胃癌中及正常組織中的表達(dá)情況
        4.3.2 DEPTOR的表達(dá)水平與胃癌患者臨床分期及預(yù)后的相關(guān)性分析
    4.4 討論
第五章 rs4871819 位點(diǎn)的不同等位基因在胃癌細(xì)胞中的活性檢測(cè)
    5.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
        5.1.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器和設(shè)備
        5.1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑
        5.1.3 實(shí)驗(yàn)材料
    5.2 實(shí)驗(yàn)方法
        5.2.1 試劑配制
        5.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)
        5.2.3 細(xì)胞的瞬時(shí)轉(zhuǎn)染
        5.2.4 熒光素酶活性的檢測(cè)
    5.3 統(tǒng)計(jì)分析
    5.4 雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)結(jié)果
    5.5 討論
第六章 全文小結(jié)
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]DEPTOR在直腸癌中的表達(dá)及對(duì)預(yù)后的影響[J]. 王娟,張朝陽(yáng),邵志林,閆國(guó)林,張?zhí)鹛?李燕,鐘春生.  局解手術(shù)學(xué)雜志. 2018(10)
[2]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He.  Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[3]mTOR結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展[J]. 陳莉君,史道華.  現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2012(11)
[4]Impact of human leukocyte antigen mismatching on outcomes of liver transplantation:A meta-analysis[J]. Xiang Lan,Ming-Man Zhang,Cong-Lun Pu,Chun-Bao Guo,Quan Kang,Ying-Chun Li,Xiao-Ke Dai,Yu-Hua Deng,Qiang Xiong,Zhi-Mei Ren,Department of Hepatobiliary Surgery and Liver Transplantation Centre,Children’s Hospital of Chongqing Medical University,136,Zhongshan 2nd Road,Yuzhong District,Chongqing 400014,China.  World Journal of Gastroenterology. 2010(27)
[5]雷帕霉素的作用機(jī)制和臨床應(yīng)用[J]. 李民.  國(guó)外醫(yī)學(xué).藥學(xué)分冊(cè). 2002(03)



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