糖尿病足潰瘍相關(guān)基因與免疫細(xì)胞特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-17 22:35
目的·探究糖尿病足潰瘍(diabetic foot ulceration,DFU)相關(guān)基因的表達(dá)以及免疫細(xì)胞的特征。方法·從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載基因表達(dá)數(shù)據(jù)集GSE80178,利用其中6個(gè)DFU樣本及3個(gè)糖尿病足皮膚(diabetic foot skin,DFS)樣本,鑒別DFU與DFS的差異表達(dá)基因(differentially expressed gene,DEG),以基因本體論(Gene Ontology,GO)注釋DEG可能涉及的生物過(guò)程及細(xì)胞成分,并利用反卷積方法計(jì)算并比較DFU、DFS及非糖尿病足部皮膚(non-diabetic foot skin,nDFS)的免疫細(xì)胞相對(duì)比例差異。結(jié)果·共獲得296個(gè)DFU與DFS的DEG,包括80個(gè)上調(diào)基因和216個(gè)下調(diào)基因。GO分析發(fā)現(xiàn),DEG在細(xì)胞成分上主要富集于細(xì)胞外泌體和細(xì)胞外空間;在生物過(guò)程中,DEG富集于角質(zhì)形成細(xì)胞分化、角質(zhì)化、中性粒細(xì)胞趨化等。DFS與nDFS比較,未發(fā)現(xiàn)免疫細(xì)胞比例差異;而DFU與DFS比較,DFU中活化肥大細(xì)胞、靜息自然殺傷細(xì)胞、CD8+ T細(xì)胞、單核細(xì)胞比例增加。結(jié)論·DFU發(fā)病過(guò)...
【文章來(lái)源】:上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,40(10)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
DFU、DFS和nDFS中免疫細(xì)胞的相對(duì)比例
DFU、DFS和nDFS中免疫細(xì)胞相對(duì)比例的比較
DFU和DFS之間的DEG
本文編號(hào):3541078
【文章來(lái)源】:上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,40(10)北大核心CSCD
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【部分圖文】:
DFU、DFS和nDFS中免疫細(xì)胞的相對(duì)比例
DFU、DFS和nDFS中免疫細(xì)胞相對(duì)比例的比較
DFU和DFS之間的DEG
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