目的:通過分析識別前列腺癌功能基因模塊并挖掘影響這些模塊的核心轉(zhuǎn)錄因子與關(guān)鍵基因,探討前列腺癌的發(fā)病機制。方法:通過加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析（weighted gene co-expressed network analysis, WGCNA）識別與前列腺癌病理分期、Gleason分級等重要臨床特征相關(guān)的樞紐基因模塊,利用OPOSSUM在線工具分析富集調(diào)控這些基因的轉(zhuǎn)錄因子,應(yīng)用通路富集分析和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析識別前列腺癌的關(guān)鍵基因及其對前列腺癌患者重要臨床特征和無病生存率（disease free survival,DFS）的影響。結(jié)果:識別出3個樞紐模塊,分別與前列腺癌病理T分期、病理N分期、Gleason分級高度相關(guān)。進一步篩選得到13個前列腺癌核心轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控這3個樞紐模塊。這些轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的差異表達基因顯著富集于Calcium、c GMP-PKG、cAMP前列腺癌相關(guān)信號通路,其組成的基因網(wǎng)絡(luò)中14個關(guān)鍵基因（PRKG1、PRKG2、CYSLTR2、GRPR、CHRM3、ADCY5、ADRA1D、EDNRA、EDNRB、CYSLTR2、AGTR1、GRPR、GRIA1和... 

【文章來源】：中國腫瘤生物治療雜志. 2020,27(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

前列腺癌異常樣本檢測與WGCN構(gòu)建

以上結(jié)果表明，篩選的核心轉(zhuǎn)錄因子通過調(diào)控樞紐模塊對前列腺癌起重要作用，并且前列腺癌中轉(zhuǎn)錄因子的活性高低往往會導(dǎo)致調(diào)控靶基因數(shù)目的變化。圖3 13個核心轉(zhuǎn)錄因子表達(A)和調(diào)控DEG的情況分析(B)

13個核心轉(zhuǎn)錄因子表達(A)和調(diào)控DEG的情況分析(B)

【參考文獻】：
期刊論文
[1]FOXM1在結(jié)直腸癌中的作用及其機制[J]. 王思毓,劉珊,蔣永新.  中國腫瘤生物治療雜志. 2020(05)
[2]前列腺癌Gleason分級[J]. 周橋.  中華病理學(xué)雜志. 2005(04)

碩士論文
[1]基于加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)的腫瘤中特異表達基因篩選方法研究[D]. 劉毅.哈爾濱工程大學(xué) 2018



本文編號：3499373