植物堿性螺旋-環(huán)-螺旋（basic helix-loop-helix, bHLH）轉(zhuǎn)錄因子是真核生物體內(nèi)第二大類轉(zhuǎn)錄因子,在植物的生長發(fā)育、次生代謝和逆境響應中起著重要作用。本研究對馬尾松（Pinus massoniana）苗期根樣品進行轉(zhuǎn)錄組測序,篩選出bHLH家族基因序列,運用生物信息學方法對其進行亞細胞定位、保守基序（motif）、表達模式及系統(tǒng)進化等分析。結(jié)果顯示,從馬尾松轉(zhuǎn)錄組中共鑒定得到64個馬尾松bHLH家族基因,經(jīng)預測主要定位在細胞核;保守基序中motif1和motif2出現(xiàn)頻率最多;在低磷脅迫條件下,PmbHLH01/09/27/29/32/39/41等基因呈顯著差異表達,可能參與低磷脅迫響應。本研究結(jié)果為進一步揭示馬尾松bHLH轉(zhuǎn)錄因子響應磷素改變的生物學功能提供參考依據(jù)。 

【文章來源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2020,28(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

馬尾松轉(zhuǎn)錄組b HLH家族成員的保守結(jié)構(gòu)域分析

根據(jù)馬尾松b HLH基因家族的轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果，隨機挑選16個基因，以q RT-PCR方法進行驗證，結(jié)果如圖5所示。比較發(fā)現(xiàn)，16個Pmb HLHs的q RT-PCR結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組的表達趨勢一致，表明轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的可靠性較高。16個Pmb HLHs的q RT-PCR結(jié)果顯示，Pmb HLH01/09/29/39/41在低磷脅迫36 d顯著下調(diào)表達(P<0.05)，恢復供磷24 h表達上升(P<0.05);Pmb HLH27/32在低磷脅迫36 d上調(diào)表達(P<0.05)，恢復供磷24 h表達下降(P<0.05)。由此推測上述7個b HLHs可能參與響應馬尾松應答低磷脅迫。3 討論

馬尾松苗進行低磷脅迫36 d及恢復供磷24 h的處理，提取根的總RNA進行轉(zhuǎn)錄組分析，對64個b HLH基因家族成員表達數(shù)據(jù)制作熱圖。結(jié)果顯示(圖4)，各b HLH基因家族成員在低磷脅迫36 d和恢復供磷24 h的表達存在差異。低磷脅迫36 d,34個基因下調(diào)表達，其中Pmb HLH01/09/29/39/41/44下調(diào)表達顯著(P<0.05);26個基因上調(diào)表達，其中Pmb HLH27/47/57上調(diào)表達較明顯(P<0.05);Pmb HLH14/38/55沒有表達；Pmb HLH25在對照組中表達，在處理組中不表達。在恢復供磷24 h,26個基因下調(diào)表達，其中Pmb HLH30下調(diào)表達明顯(P<0.05);35個基因上調(diào)表達，其中Pmb HLH35/49/57上調(diào)表達較明顯(P<0.05),Pmb HLH14/38/55沒有表達。根據(jù)馬尾松b HLH基因家族的轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果，隨機挑選16個基因，以q RT-PCR方法進行驗證，結(jié)果如圖5所示。比較發(fā)現(xiàn)，16個Pmb HLHs的q RT-PCR結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組的表達趨勢一致，表明轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的可靠性較高。16個Pmb HLHs的q RT-PCR結(jié)果顯示，Pmb HLH01/09/29/39/41在低磷脅迫36 d顯著下調(diào)表達(P<0.05)，恢復供磷24 h表達上升(P<0.05);Pmb HLH27/32在低磷脅迫36 d上調(diào)表達(P<0.05)，恢復供磷24 h表達下降(P<0.05)。由此推測上述7個b HLHs可能參與響應馬尾松應答低磷脅迫。

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3417340