辣椒PSY基因家族分析及CaPSY1功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-09-19 15:39
八氫番茄紅素合成酶(PSY,phytoene synthase)是類胡蘿卜素合成途徑的第一個(gè)限制酶,在果實(shí)發(fā)育中起著重要的作用。然而,CaPSY基因在果實(shí)成熟過程中基因組范圍內(nèi)的表達(dá)模式還不清楚。本研究中,我們對(duì)辣椒中PSY基因家族進(jìn)行了鑒定,并用生物信息學(xué)方法對(duì)PSY基因家族進(jìn)行了分析,并對(duì)其與非生物脅迫之間的關(guān)系進(jìn)行了研究。為探究CaPSY1基因在辣椒果實(shí)中的作用,我們構(gòu)建了GFP熒光定位載體分析其定位情況;我們還構(gòu)建了VIGS-CaPSY1沉默載體,在辣椒轉(zhuǎn)色期沉默果實(shí)CaPSY1基因,分析其表型及相關(guān)基因表達(dá)量;我們還構(gòu)建了過表達(dá)載體,在擬南芥中遺傳轉(zhuǎn)化。結(jié)果如下:(1)通過已公布的辣椒遵辣1號(hào)基因組數(shù)據(jù)庫(kù),運(yùn)用Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)和Blast等技術(shù),我們?cè)诶苯分泄茶b定出3個(gè)同源PSY基因,對(duì)其命名CaPSY1、CaPSY2.a和CaPSY2.b。通過生物信息學(xué)分析,我們發(fā)現(xiàn)3個(gè)PSY基因中都只含有5個(gè)內(nèi)含子,并且我們?cè)谄涞鞍仔蛄兄邪l(fā)現(xiàn)8個(gè)motif,PSY基因的活性位點(diǎn)DXXXD只存在于motif 2和motif 3中。在對(duì)單子葉和雙子葉植物中PSY基因進(jìn)化關(guān)系的研究中,我們發(fā)現(xiàn)C...
【文章來(lái)源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:80 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
類胡蘿卜素合成途徑(引自[24]
員與擬南芥 PSY 基因氨基酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)所有的基因都含有 DXXXD 保守結(jié)構(gòu)域,并且該結(jié)構(gòu)域高度保守(圖 2.1)。所以辣椒 PSY 基因可能與擬南芥 PSY 基因行駛相同的功能。
圖 2.2 辣椒 PSY 基因染色體定位igure 2.2 Chromosome localization of pepper PS家族結(jié)構(gòu)分析構(gòu)和基序分布分析能更好理解它們結(jié)構(gòu)構(gòu)是相似的。PSY 蛋白中鑒定出來(lái) 8 PSY1 和 CaPSY2.b,預(yù)測(cè)活性位點(diǎn) DXX位點(diǎn)(圖 2.3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]芒果八氫番茄紅素合成酶基因PSY的結(jié)構(gòu)分析及功能預(yù)測(cè)[J]. 黃建峰,秦于玲,高愛平,趙志常,黨志國(guó),羅睿雄,陳業(yè)淵. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]辣椒CaWRKY13基因克隆及非生物脅迫下表達(dá)分析[J]. 魏小春,姚秋菊,原玉香,趙艷艷,王志勇,姜俊,蔣武生,張曉偉. 分子植物育種. 2016(10)
[3]基于綠色熒光蛋白瞬時(shí)表達(dá)的植物亞細(xì)胞定位方法[J]. 于一帆,朱小彬,葛會(huì)敏,陳云. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[4]幾種經(jīng)濟(jì)植物UFGT基因的生物信息學(xué)分析[J]. 付海輝,辛培堯,許玉蘭,劉巖,韋援教,董嬌,曹有龍,周軍. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2011(01)
[5]Tissue differential expression of lycopene β-cyclase gene in papaya[J]. RachelLSkelton,RajeswariSrinivasan,RichardManshardt,Paul H Moore,Ray Ming. Cell Research. 2006(08)
本文編號(hào):3401883
【文章來(lái)源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:80 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
類胡蘿卜素合成途徑(引自[24]
員與擬南芥 PSY 基因氨基酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)所有的基因都含有 DXXXD 保守結(jié)構(gòu)域,并且該結(jié)構(gòu)域高度保守(圖 2.1)。所以辣椒 PSY 基因可能與擬南芥 PSY 基因行駛相同的功能。
圖 2.2 辣椒 PSY 基因染色體定位igure 2.2 Chromosome localization of pepper PS家族結(jié)構(gòu)分析構(gòu)和基序分布分析能更好理解它們結(jié)構(gòu)構(gòu)是相似的。PSY 蛋白中鑒定出來(lái) 8 PSY1 和 CaPSY2.b,預(yù)測(cè)活性位點(diǎn) DXX位點(diǎn)(圖 2.3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]芒果八氫番茄紅素合成酶基因PSY的結(jié)構(gòu)分析及功能預(yù)測(cè)[J]. 黃建峰,秦于玲,高愛平,趙志常,黨志國(guó),羅睿雄,陳業(yè)淵. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]辣椒CaWRKY13基因克隆及非生物脅迫下表達(dá)分析[J]. 魏小春,姚秋菊,原玉香,趙艷艷,王志勇,姜俊,蔣武生,張曉偉. 分子植物育種. 2016(10)
[3]基于綠色熒光蛋白瞬時(shí)表達(dá)的植物亞細(xì)胞定位方法[J]. 于一帆,朱小彬,葛會(huì)敏,陳云. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(12)
[4]幾種經(jīng)濟(jì)植物UFGT基因的生物信息學(xué)分析[J]. 付海輝,辛培堯,許玉蘭,劉巖,韋援教,董嬌,曹有龍,周軍. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2011(01)
[5]Tissue differential expression of lycopene β-cyclase gene in papaya[J]. RachelLSkelton,RajeswariSrinivasan,RichardManshardt,Paul H Moore,Ray Ming. Cell Research. 2006(08)
本文編號(hào):3401883
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