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17α-乙炔基雌二醇對(duì)黃顙魚稚魚性逆轉(zhuǎn)的誘導(dǎo)作用及關(guān)鍵基因篩選

發(fā)布時(shí)間:2021-08-20 00:30
  魚類的性別決定和分化受到遺傳因素和環(huán)境因素的共同影響,環(huán)境中外源性類固醇激素往往可以徹底改變遺傳因素決定的性別分化方向。本研究分別以粉碎的黃顙魚飼料和鹵蟲作為激素載體,設(shè)置不同的EE2處理濃度,在稚魚生長(zhǎng)的不同時(shí)期對(duì)其進(jìn)行處理,通過測(cè)定雌性率、性腺未發(fā)育個(gè)體占比以及成活率確定不同載體、不同生長(zhǎng)時(shí)期和不同濃度處理對(duì)性別逆轉(zhuǎn)的作用;并通過測(cè)定全雄黃顙魚在處理后的增重率、特定生長(zhǎng)率和肥滿度以確定EE2(17α-乙炔基雌二醇)處理對(duì)雄性黃顙魚稚魚生長(zhǎng)的影響;由此綜合確定EE2處理黃顙魚稚魚性逆轉(zhuǎn)的適宜載體、適宜處理濃度和適宜處理時(shí)期。以鹵蟲為載體使用濃度為200 μg/L的EE2連續(xù)處理9 dah全雄黃顙魚40天,分別對(duì)處理0天、20天和40天的黃顙魚性腺組織中的轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,并對(duì)處理0天、20天和40天時(shí)雄性黃顙魚性腺中Cyp11b2、Cyp19a1a和Cyp17a的表達(dá)量通過熒光定量PCR檢測(cè),確定EE2誘導(dǎo)黃顙魚稚魚性逆轉(zhuǎn)過程中可能的關(guān)鍵基因,為進(jìn)一步研究黃顙魚性別決定和性別維持的分子機(jī)制提供理論依據(jù),為黃顙魚的遺傳育種提供理論和技術(shù)支持。結(jié)果如下:1.以飼料為載體的不同濃度... 

【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】:80 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

17α-乙炔基雌二醇對(duì)黃顙魚稚魚性逆轉(zhuǎn)的誘導(dǎo)作用及關(guān)鍵基因篩選


圖1魚性類固醇激素合成示意圖(Nagahama,?1997)??Fig.l?Schematic?representation?of?synthesis?of?sex?steroids?of?fish?(Nagahama,?1997)??1.5.2魚類性激素合成調(diào)控的重要基因??

生物信息,分析流程,測(cè)序,流程圖


圖3建庫(kù)測(cè)序流程圖??Fig.3?Experiment?pipeline?of?sequencing??生物信息分析流程??)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序原始數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)與拼接??測(cè)序產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)(Raw?data)進(jìn)行預(yù)處理,通過cutadapt去除測(cè)序m過濾不合格的序列,得到有效數(shù)據(jù)(Cleandeta)。??本混合組裝的策略,將所有樣本最后進(jìn)行歸一化得到unigene?(unigen因進(jìn)行去冗余去重復(fù)后得到的唯一),作為后續(xù)分析的參考序列。進(jìn)行組裝質(zhì)量的評(píng)判,包括unigene的長(zhǎng)度、GC含量和N50等。N50錄組拼接結(jié)果好壞的一個(gè)判斷標(biāo)準(zhǔn),將所有組裝出來的結(jié)果按照長(zhǎng)度,當(dāng)達(dá)到總長(zhǎng)度一半時(shí)的長(zhǎng)度為N50。??基因功能注釋及分類??件DIAMOND對(duì)組裝完的unigenes添加相應(yīng)的功能注釋。數(shù)據(jù)庫(kù)來

含量分布,測(cè)序,揚(yáng)州大學(xué)


揚(yáng)州大學(xué)碩士論文。一般情況下,Q30大于80%就認(rèn)為是可靠的。本試驗(yàn)所有樣品的Q200都大于95%,因此認(rèn)為本實(shí)驗(yàn)測(cè)序結(jié)果可靠。GC含量平均值為48.63布,GC含量過高(大于80%)或過低(小于20%)的unigenes不存在,成情況良好,測(cè)序質(zhì)量較好。??OC?Content?DtftirK>uti〇n??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3352443

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