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BSA·QTL-seq分離控制青稞藍(lán)粒性狀的可能性候選基因HvMYC1和HvMYB1

發(fā)布時(shí)間:2021-07-24 23:21
  青稞又稱裸大麥,屬于禾本科大麥屬。有色青稞含有高水平的營(yíng)養(yǎng)成分,如花青素、酚類化合物、蛋白質(zhì)和微量元素。藍(lán)粒青稞作為有色青稞的一類,是由花青素大量沉積于青稞糊粉層所形成的。本研究主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:1.采用BSA·QTL-seq方法對(duì)青稞藍(lán);蚪M進(jìn)行了高通量測(cè)序,確定兩類共7452819個(gè)SNP以及其在7條染色體上的分布情況,得到一個(gè)明顯的QTL區(qū)并在該區(qū)域內(nèi)預(yù)測(cè)基因853個(gè),其中MYB和bHLH相關(guān)基因各5個(gè)。QTL區(qū)域的4個(gè)MYB基因與擬南芥中的MYB基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,發(fā)現(xiàn)其中只有一個(gè)候選基因HvMYB1與調(diào)控花青素合成的MYB基因聚為一類。同樣發(fā)現(xiàn)在候選基因區(qū)段中只有一個(gè)MYC候選基因HvMYC1與MYC基因聚為一類。這暗示了它們可能為控制藍(lán)粒性狀的候選基因,經(jīng)過(guò)比對(duì)與先前的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究結(jié)果一致。而且候選基因HvMYC1與HvMYB1的QTL分析結(jié)果在與藍(lán)粒小麥性狀相關(guān)的QTL巔峰區(qū)域525.9-541.7Mb之內(nèi),更加說(shuō)明這兩個(gè)基因極有可能為控制藍(lán)粒性狀的主效基因。2.分別對(duì)候選基因HvMYC1與HvMYB1進(jìn)行序列結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)HvMYC1基因全長(zhǎng)1668bp,編碼555... 

【文章來(lái)源】:青海師范大學(xué)青海省

【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

BSA·QTL-seq分離控制青稞藍(lán)粒性狀的可能性候選基因HvMYC1和HvMYB1


花青素生物合成途徑Figureure1-1biosyntheticpathwayofanthocyanins

花青素,轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)控結(jié)構(gòu),共基


Figureure 1-1 biosynthetic pathway of anthocyan合成受結(jié)構(gòu)基因和轉(zhuǎn)錄因子的共同控制,其中結(jié)形成相應(yīng)的合成途徑;轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控結(jié)構(gòu)基因的素的合成。目前已知花青素合成涉及三種主要子,bHLH 轉(zhuǎn)錄因子和 WD40 轉(zhuǎn)錄因子,它們共基因的啟動(dòng)子來(lái)發(fā)揮作用。

青稞,藍(lán)粒,實(shí)驗(yàn)材料,昆侖


A B圖 3-1 實(shí)驗(yàn)材料藍(lán)粒青稞‘肚里黃’(A)和白粒青稞‘昆侖 1-1 Experimental material blue highland barley ‘Yellow belly’ (A)barley ‘Kunlun10’ (B)要實(shí)驗(yàn)試劑及儀器表 3-1 主要實(shí)驗(yàn)試劑Table 3-1 Main experimental reagents供應(yīng)商N(yùn)Aprep 純植物試劑盒 Tiangen 公司idi Purification Kit 膠回收試劑盒 天根生化科技有First Strand cDNA Synthesis KitThermo Scientif

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甘蔗花青素轉(zhuǎn)錄因子基因ScRS克隆與基因槍轉(zhuǎn)化研究[J]. 劉迪,施桂姣,肖乃衍,Khalil Farghama,許躍語(yǔ),陳平華,張卓,王恒波,高三基,許莉萍,張華.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2017(07)
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[3]苦蕎轉(zhuǎn)錄因子基因FtbHLH3的克隆及其非生物脅迫下的表達(dá)分析[J]. 姚攀鋒,趙學(xué)榮,李茂菲,王安虎,吳琦.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(02)
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[10]黑糯大麥的品種特性及營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)分析[J]. 張想平,雷耀湖,何慶祥,毋玲玲.  種子. 2011(09)

博士論文
[1]甘藍(lán)類蔬菜抗根腫病基因定位、克隆及抗感材料比較轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 張小麗.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
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[3]ABA介導(dǎo)的PacMYBA調(diào)控紅肉甜櫻桃果實(shí)花色苷合成的研究[D]. 沈欣杰.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]基于高通量測(cè)序的瓜葉菊花青素苷合成途徑研究[D]. 金雪花.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[5]類黃酮調(diào)控基因AtMYB12的異源表達(dá)及其對(duì)植物抗病性的貢獻(xiàn)[D]. 李明.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012

碩士論文
[1]青稞藍(lán)粒性狀的遺傳分析及主效基因分離[D]. 趙鑫.青海師范大學(xué) 2018
[2]玉米雄穗穗頸長(zhǎng)QTL初步定位[D]. 李曉娜.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]水稻苗期耐旱性基因位點(diǎn)的發(fā)掘[D]. 姜雪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]棉花bHLH蛋白基因的克隆、表達(dá)及生物信息學(xué)分析[D]. 劉厚生.西南大學(xué) 2014
[5]擬南芥干旱誘導(dǎo)型啟動(dòng)子的克隆及功能分析[D]. 吳憲.吉林大學(xué) 2013



本文編號(hào):3301635

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