癌癥疼痛基因的生物信息學(xué)分析及其臨床意義
發(fā)布時(shí)間:2021-06-18 10:19
目的對(duì)癌癥疼痛基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析和篩選,為癌癥患者的疼痛治療提供依據(jù)。方法從高通量基因表達(dá)(GEO)數(shù)據(jù)庫(kù)下載GSE47603數(shù)據(jù)并整理分析,利用BART和Metascape(http://metascape.org/gp/index.html)數(shù)據(jù)庫(kù)繪制火山圖、熱圖以及進(jìn)行基因本體(GO)功能注釋和京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)分析,再利用基因、蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系檢索工具(String)數(shù)據(jù)庫(kù)和Cytoscape軟件進(jìn)行蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)和關(guān)鍵基因篩選,最后再利用Oncomine腫瘤芯片數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)篩選的關(guān)鍵基因進(jìn)行腫瘤相關(guān)分析。結(jié)果通過(guò)對(duì)GSE47603數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,共得到37個(gè)差異基因,其中表達(dá)下調(diào)的基因4個(gè),表達(dá)上調(diào)的基因33個(gè);差異表達(dá)基因的GO功能主要富集在細(xì)胞因子介導(dǎo)、細(xì)胞對(duì)γ干擾素反應(yīng)、對(duì)外部刺激反應(yīng)的調(diào)節(jié)和神經(jīng)遞質(zhì)的生物合成等上,KEGG主要富集在細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體的相互作用通路、白細(xì)胞介素(IL)-7信號(hào)通路和造血細(xì)胞調(diào)節(jié)等通路;通過(guò)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行關(guān)鍵基因篩選得到得分排名居前10位的關(guān)鍵基因分別為非肌性肌球蛋白重鏈9(MYH9)、CXC趨...
【文章來(lái)源】:中國(guó)醫(yī)藥指南. 2020,18(28)
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【部分圖文】:
火山圖和熱圖
關(guān)鍵基因篩選圖表2關(guān)鍵基因得分排名情況排名關(guān)鍵基因得分1MYH97
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)胰腺癌多學(xué)科綜合治療模式專(zhuān)家共識(shí)(2020版)[J]. 中華腫瘤雜志. 2020(07)
[2]特異性蛋白1在胰腺癌中的生物學(xué)作用及對(duì)細(xì)胞因子網(wǎng)絡(luò)的影響[J]. 焦鋒,韓婷,卓萌,梁依依,王理偉. 臨床腫瘤學(xué)雜志. 2020(05)
[3]2012-2017年濰坊市惡性腫瘤發(fā)病與死亡流行病特征及變化趨勢(shì)分析[J]. 李寧,李亮,陳作森,孟顯峰. 中華腫瘤防治雜志. 2019(12)
[4]癌性疼痛,腫瘤患者的嚴(yán)重威脅[J]. 歐陽(yáng)雪巖,楊超,朱朕,李靜,孫運(yùn)恒,丁罡,吉永華,姜峰. 生理學(xué)報(bào). 2019(02)
[5]胸部神經(jīng)阻滯對(duì)乳腺癌改良根治術(shù)患者術(shù)后疼痛及炎性細(xì)胞因子的影響[J]. 姚華琪,邱萍,程倩,顏偉. 江蘇醫(yī)藥. 2019(02)
[6]神經(jīng)病理性疼痛大鼠海馬促炎性細(xì)胞因子的表達(dá)水平變化[J]. 杜仁峰,郭朝暉,李永男,田潤(rùn)利,羅慶玲,趙海燕. 卒中與神經(jīng)疾病. 2018(06)
[7]川芎嗪對(duì)神經(jīng)病理性疼痛模型大鼠的鎮(zhèn)痛作用及對(duì)腦中樞敏化區(qū)氨基酸類(lèi)神經(jīng)遞質(zhì)含量的影響[J]. 張美玉,焦玥,劉洋,李玉娟,趙小亮,李濤. 中國(guó)藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志. 2018(12)
[8]白細(xì)胞介素7對(duì)非小細(xì)胞肺癌患者CD8+T細(xì)胞抗腫瘤活性的影響[J]. 張小紅,王紅民,靳莉,常瑞,祖翡翠,李風(fēng)芝,庫(kù)春燕. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2018(30)
[9]穴位注射治療帶狀皰疹的臨床觀察[J]. 景萬(wàn)倉(cāng). 光明中醫(yī). 2018(13)
[10]腫瘤患者癌性疼痛和心理痛苦及營(yíng)養(yǎng)不良的相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 羅迪,張雪,鄧窈窕. 中國(guó)全科醫(yī)學(xué). 2018(29)
本文編號(hào):3236487
【文章來(lái)源】:中國(guó)醫(yī)藥指南. 2020,18(28)
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【部分圖文】:
火山圖和熱圖
關(guān)鍵基因篩選圖表2關(guān)鍵基因得分排名情況排名關(guān)鍵基因得分1MYH97
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)胰腺癌多學(xué)科綜合治療模式專(zhuān)家共識(shí)(2020版)[J]. 中華腫瘤雜志. 2020(07)
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[3]2012-2017年濰坊市惡性腫瘤發(fā)病與死亡流行病特征及變化趨勢(shì)分析[J]. 李寧,李亮,陳作森,孟顯峰. 中華腫瘤防治雜志. 2019(12)
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[6]神經(jīng)病理性疼痛大鼠海馬促炎性細(xì)胞因子的表達(dá)水平變化[J]. 杜仁峰,郭朝暉,李永男,田潤(rùn)利,羅慶玲,趙海燕. 卒中與神經(jīng)疾病. 2018(06)
[7]川芎嗪對(duì)神經(jīng)病理性疼痛模型大鼠的鎮(zhèn)痛作用及對(duì)腦中樞敏化區(qū)氨基酸類(lèi)神經(jīng)遞質(zhì)含量的影響[J]. 張美玉,焦玥,劉洋,李玉娟,趙小亮,李濤. 中國(guó)藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志. 2018(12)
[8]白細(xì)胞介素7對(duì)非小細(xì)胞肺癌患者CD8+T細(xì)胞抗腫瘤活性的影響[J]. 張小紅,王紅民,靳莉,常瑞,祖翡翠,李風(fēng)芝,庫(kù)春燕. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2018(30)
[9]穴位注射治療帶狀皰疹的臨床觀察[J]. 景萬(wàn)倉(cāng). 光明中醫(yī). 2018(13)
[10]腫瘤患者癌性疼痛和心理痛苦及營(yíng)養(yǎng)不良的相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 羅迪,張雪,鄧窈窕. 中國(guó)全科醫(yī)學(xué). 2018(29)
本文編號(hào):3236487
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