基于線粒體和核基因序列分析單環(huán)刺螠(Urechis unicinctus)種群遺傳多樣性
發(fā)布時間:2021-04-25 07:06
單環(huán)刺螠是一種身體不分節(jié),兩側(cè)對稱,并有體腔的軟體海洋蠕蟲,具有豐富的營養(yǎng)價值和藥用價值。隸屬螠蟲動物門(Echiurioidea)、螠綱(Echiurida)、無管螠目(Xenopneusta)、刺螠科(Urechidae)、刺螠屬(Urechis),是無管螠目在我國沿海分布的唯一種類。其分布區(qū)狹窄,主要分布于中國渤海灣、韓國和日本海域。由于海洋污染導致單環(huán)刺螠棲息地減少,再加上過度捕撈致使其種群數(shù)量的大范圍縮減。然而,對于單環(huán)刺螠種群的遺傳多樣性和結(jié)構(gòu)都沒有采取過系統(tǒng)性研究。在本研究,我們收集了中國渤海灣(煙臺、大連、萊州、秦皇島、葫蘆島)、韓國慶尚道南?す6個地區(qū)105個單環(huán)刺螠樣品,并結(jié)合GenBank中9個COI和1個28S-rRNA日本樣品的基因序列,通過線粒體COI(457 bp),16S-rRNA(451bp)與核基因28S-rRNA(680 bp)基因片段,對單環(huán)刺螠種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進行分析;贑OI序列,單環(huán)刺螠遺傳多樣性仍居于較高程度(單倍型多樣性:0.9595,核苷酸多樣性:0.0101)。在3個基因標記中,由28S-rRNA序列所定義的遺傳多樣性最...
【文章來源】:魯東大學山東省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 單環(huán)刺螠的研究概況
1.1.1 形態(tài)特征
1.1.2 分布及分類地位
1.1.3 生殖和發(fā)育
1.1.4 營養(yǎng)價值與藥用價值
1.1.5 研究現(xiàn)狀
1.1.6 待解決問題
1.2 種群遺傳多樣性概述與研究方法
1.2.1 種群遺傳多樣性概述
1.2.2 種群遺傳多樣性研究方法
1.2.2.1 形態(tài)學方法
1.2.2.2 細胞方法
1.2.2.3 分子標記方法
1.2.3 分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建
1.2.3.1 距離矩陣法(Distance-matrixmethods)
1.2.3.2 最大簡約法(Maximumparsimony)
1.2.3.3 最大似然法(MaximumLikelihoodmethod)
1.2.3.4 貝葉斯法(Bayesianmethod)
1.3 線粒體與核基因在海洋生物群體遺傳學的應用
1.3.1 線粒體COI基因在海洋生物群體遺傳學的應用
1.3.2 線粒體16S-rRNA基因在海洋動物群體遺傳學的應用
1.3.3 核基因28S-rRNA在海洋動物群體遺傳學的應用
1.4 本研究的目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 供試材料
2.2 DNA的提取
2.3 PCR擴增
2.4 PCR擴增產(chǎn)物檢測
2.5 序列測定
2.6 數(shù)據(jù)處理
2.6.1 序列分析
2.6.2 單倍型系統(tǒng)進化關系
2.6.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)
2.6.4 種群歷史動態(tài)
第3章 結(jié)果分析
3.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性
3.2 單環(huán)刺螠種群遺傳結(jié)構(gòu)
3.3 單環(huán)刺螠群體歷史動態(tài)
第4章 討論
4.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)
4.2 單環(huán)刺螠種群歷史動態(tài)
第5章 總結(jié)
參考文獻
作者簡歷
本文編號:3158943
【文章來源】:魯東大學山東省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 單環(huán)刺螠的研究概況
1.1.1 形態(tài)特征
1.1.2 分布及分類地位
1.1.3 生殖和發(fā)育
1.1.4 營養(yǎng)價值與藥用價值
1.1.5 研究現(xiàn)狀
1.1.6 待解決問題
1.2 種群遺傳多樣性概述與研究方法
1.2.1 種群遺傳多樣性概述
1.2.2 種群遺傳多樣性研究方法
1.2.2.1 形態(tài)學方法
1.2.2.2 細胞方法
1.2.2.3 分子標記方法
1.2.3 分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建
1.2.3.1 距離矩陣法(Distance-matrixmethods)
1.2.3.2 最大簡約法(Maximumparsimony)
1.2.3.3 最大似然法(MaximumLikelihoodmethod)
1.2.3.4 貝葉斯法(Bayesianmethod)
1.3 線粒體與核基因在海洋生物群體遺傳學的應用
1.3.1 線粒體COI基因在海洋生物群體遺傳學的應用
1.3.2 線粒體16S-rRNA基因在海洋動物群體遺傳學的應用
1.3.3 核基因28S-rRNA在海洋動物群體遺傳學的應用
1.4 本研究的目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 供試材料
2.2 DNA的提取
2.3 PCR擴增
2.4 PCR擴增產(chǎn)物檢測
2.5 序列測定
2.6 數(shù)據(jù)處理
2.6.1 序列分析
2.6.2 單倍型系統(tǒng)進化關系
2.6.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)
2.6.4 種群歷史動態(tài)
第3章 結(jié)果分析
3.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性
3.2 單環(huán)刺螠種群遺傳結(jié)構(gòu)
3.3 單環(huán)刺螠群體歷史動態(tài)
第4章 討論
4.1 單環(huán)刺螠遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)
4.2 單環(huán)刺螠種群歷史動態(tài)
第5章 總結(jié)
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作者簡歷
本文編號:3158943
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