MdERF2基因啟動子的克隆及其轉(zhuǎn)錄活性分析
發(fā)布時間:2021-01-30 21:31
蘋果是典型的呼吸躍變型果實,在其生長發(fā)育過程中,乙烯起了至關(guān)重要的作用。ERF家族轉(zhuǎn)錄因子屬于乙烯信號通路中直接對靶基因起作用的關(guān)鍵因子,而MdERF2基因是乙烯調(diào)控蘋果果實發(fā)育與品質(zhì)的重要的轉(zhuǎn)錄因子,但目前對于乙烯調(diào)控MdERF2的機理及效果仍然不能確定,本文分析了MdERF2基因啟動子序列特性,并利用含β-葡萄糖苷酸酶(GUS)和綠色熒光蛋白(GFP)的瞬時表達載體,雙重研究和驗證了乙烯及其抑制劑1-MCP對MdERF2基因啟動子的調(diào)控模式,主要結(jié)果如下:采用PCR技術(shù)擴增MdERF2基因啟動子,序列分析表明,擴增獲得的啟動子全長為1348 bp。利用Plant CARE和PLACE數(shù)據(jù)庫分析基因啟動子中所含有的順式作用元件,發(fā)現(xiàn)具有TATA框和CAAT框等基礎(chǔ)元件,還具有GARE-motif、CCAAT-box、Box4、GT1-motif和MBS等其它元件。構(gòu)建pRI-ProMdERF2-GUS啟動子瞬時表達載體,采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法瞬時轉(zhuǎn)化番茄果實和葉片來驗證啟動子的活性。結(jié)果表明:由Pro MdERF2驅(qū)動的GUS基因,在1-MCP、乙烯利以及空白的三種處理下,番茄果實和葉片均...
【文章來源】:山東理工大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
新紅星蘋果基因組DNA的提取結(jié)果
山東理工大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章蘋果MdERF2啟動子擴增與瞬時表達載體的構(gòu)建212.3.2MdERF2基因啟動子的PCR擴增以ERF2-F/ERF2-R為擴增引物,提取的新紅星蘋果基因組DNA為模板擴增MdERF2基因啟動子序列,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,擴增出一條約1300bp左右的條帶(圖2.2),擴增出的特異性產(chǎn)物大小均與預(yù)期PCR產(chǎn)物大小一致。圖2.2MdERF2基因啟動子PCR產(chǎn)物Fig.2.2PCRproductofMdERF2genepromoter注:M:DL2000Marker;1-6:MdERF2基因啟動子PCR產(chǎn)物2.3.3啟動子序列測序及序列分析將PCR擴增的產(chǎn)物送至上海生工生物工程(濟南)有限公司測序,序列采用在線軟件預(yù)測其中的順式作用元件,結(jié)果見圖2.3。結(jié)果顯示,PCR擴增所獲得的啟動子長度為1348bp,同源比對結(jié)果顯示與NCBI上蘋果MdERF2基因啟動子序列的同源性達到99%,將該啟動子命名為ProMdERF2。表2.9核心啟動子區(qū)域預(yù)測Tab.2.9Predictionofcorepromoter起始位點結(jié)束位點得分核心啟動子區(qū)-581-5300.99TCAGTGTGCATATAGAAACCGTGCAGCCCCAACGGCACACGTGACAGAAG-41+100.99CCTGACTTCTATATATACCCCTAGATACCTTCTCTTCCACAATTCGTGAA采用BerkeleyDrosophilaGenomeProject數(shù)據(jù)庫對ProMdERF2序列中所含的核心區(qū)域進行預(yù)測,預(yù)測結(jié)果表明該序列中含兩處核心啟動子區(qū)域,結(jié)果見表2.9。使用Softberry
山東理工大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章蘋果MdERF2啟動子擴增與瞬時表達載體的構(gòu)建26表2.14MatrixCatch2.7軟件預(yù)測結(jié)果Tab.2.14ForecastresultsfromMatrixCatch2.7softwareFactornameP-ValueSequenceCREBP1CJUN1.051e-02TGACTTTGCAATTTCCATTCHNF31.720e-02GTTGTATATCCTAGttgtaacttgtaagtgtgtcaATAAAAAAATAAAHNF33.518e-02TCAGTTTGACAACGcatgctgagagtaactacagataAAAACTAAACATGNFKBHMGIY1.963e-02AGGCAGAAAATT2.3.5pRI-ProMdERF2-GFP表達載體的構(gòu)建用HindIII和XbaI雙酶切MdERF2啟動子片段,同時用HindIII和XbaI雙酶切pRI-101-GFP載體,分別回收線性化的pRI-101-GFP載體(圖2.4a)和啟動子片段(圖2.4b)。經(jīng)HindIII和XbaI雙酶切獲得的MdERF2啟動子與經(jīng)相同限制性核酸內(nèi)切酶雙酶切獲得的線性化載體,用T4-DNA連接酶連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,涂布含50mg/LKan的LB固體培養(yǎng)基篩選培養(yǎng)。圖2.4pRI-101-GFP載體及MdERF2啟動子片段用HindIII和XbaI雙酶切回收電泳圖Fig.2.4RecoveryelectrophoresisofpRI-101-GFPvectorandpromoterfragmentsbydigestwithHindIIIandXbaI注:a:pRI-101-GFP載體酶切回收圖(M:DL15000Marker;1:pRI-101-GFP載體用HindIII和XbaI雙酶切回收圖);b:ERF2啟動子酶切回收圖(M:DL2000Marker;1:MdERF2啟動子用HindIII和XbaI雙酶切回收圖)
本文編號:3009621
【文章來源】:山東理工大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
新紅星蘋果基因組DNA的提取結(jié)果
山東理工大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章蘋果MdERF2啟動子擴增與瞬時表達載體的構(gòu)建212.3.2MdERF2基因啟動子的PCR擴增以ERF2-F/ERF2-R為擴增引物,提取的新紅星蘋果基因組DNA為模板擴增MdERF2基因啟動子序列,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,擴增出一條約1300bp左右的條帶(圖2.2),擴增出的特異性產(chǎn)物大小均與預(yù)期PCR產(chǎn)物大小一致。圖2.2MdERF2基因啟動子PCR產(chǎn)物Fig.2.2PCRproductofMdERF2genepromoter注:M:DL2000Marker;1-6:MdERF2基因啟動子PCR產(chǎn)物2.3.3啟動子序列測序及序列分析將PCR擴增的產(chǎn)物送至上海生工生物工程(濟南)有限公司測序,序列采用在線軟件預(yù)測其中的順式作用元件,結(jié)果見圖2.3。結(jié)果顯示,PCR擴增所獲得的啟動子長度為1348bp,同源比對結(jié)果顯示與NCBI上蘋果MdERF2基因啟動子序列的同源性達到99%,將該啟動子命名為ProMdERF2。表2.9核心啟動子區(qū)域預(yù)測Tab.2.9Predictionofcorepromoter起始位點結(jié)束位點得分核心啟動子區(qū)-581-5300.99TCAGTGTGCATATAGAAACCGTGCAGCCCCAACGGCACACGTGACAGAAG-41+100.99CCTGACTTCTATATATACCCCTAGATACCTTCTCTTCCACAATTCGTGAA采用BerkeleyDrosophilaGenomeProject數(shù)據(jù)庫對ProMdERF2序列中所含的核心區(qū)域進行預(yù)測,預(yù)測結(jié)果表明該序列中含兩處核心啟動子區(qū)域,結(jié)果見表2.9。使用Softberry
山東理工大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章蘋果MdERF2啟動子擴增與瞬時表達載體的構(gòu)建26表2.14MatrixCatch2.7軟件預(yù)測結(jié)果Tab.2.14ForecastresultsfromMatrixCatch2.7softwareFactornameP-ValueSequenceCREBP1CJUN1.051e-02TGACTTTGCAATTTCCATTCHNF31.720e-02GTTGTATATCCTAGttgtaacttgtaagtgtgtcaATAAAAAAATAAAHNF33.518e-02TCAGTTTGACAACGcatgctgagagtaactacagataAAAACTAAACATGNFKBHMGIY1.963e-02AGGCAGAAAATT2.3.5pRI-ProMdERF2-GFP表達載體的構(gòu)建用HindIII和XbaI雙酶切MdERF2啟動子片段,同時用HindIII和XbaI雙酶切pRI-101-GFP載體,分別回收線性化的pRI-101-GFP載體(圖2.4a)和啟動子片段(圖2.4b)。經(jīng)HindIII和XbaI雙酶切獲得的MdERF2啟動子與經(jīng)相同限制性核酸內(nèi)切酶雙酶切獲得的線性化載體,用T4-DNA連接酶連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,涂布含50mg/LKan的LB固體培養(yǎng)基篩選培養(yǎng)。圖2.4pRI-101-GFP載體及MdERF2啟動子片段用HindIII和XbaI雙酶切回收電泳圖Fig.2.4RecoveryelectrophoresisofpRI-101-GFPvectorandpromoterfragmentsbydigestwithHindIIIandXbaI注:a:pRI-101-GFP載體酶切回收圖(M:DL15000Marker;1:pRI-101-GFP載體用HindIII和XbaI雙酶切回收圖);b:ERF2啟動子酶切回收圖(M:DL2000Marker;1:MdERF2啟動子用HindIII和XbaI雙酶切回收圖)
本文編號:3009621
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