對海南地區(qū)Bt菌株cry基因的鑒定、克隆及蛋白活性分析
【學(xué)位授予單位】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S482.39;Q78
【圖文】:
東北農(nóng)業(yè)大學(xué)理學(xué)碩士學(xué)位論文最后,同源性高于 95%的蛋白在第四等級里進行類別區(qū)分[18]。不管怎樣,這種法可為每個獨立編碼蛋白的基因序列進行分類,因此,盡管有些蛋白可能在第四但實際上它們的氨基酸序列也可能是相同的[18]。這種命名系統(tǒng)通常用于 Bt 蛋素(Cry 和 Cyt)和分泌蛋白(Vip 和 Sip)的命名與分類。到目前為止,共Cry1-Cry74,Cyt1-Cyt3,Vip1-Vip4,Sip)包括 349 種模式基因。
盡管結(jié)果發(fā)現(xiàn)這九種毒素蛋白的氨基酸序列和殺蟲特異性差別較大,但它們活性區(qū)域卻具有一致的結(jié)構(gòu):即大部分ICPs的結(jié)構(gòu)域主要包括Domain I、Domain II和Domain III(圖1-3)。Domain I位于活性Cry蛋白的N-末端于1991年由Li等首次報道[30]。它包括一個α-螺旋束,在這個α-螺旋束中,一個疏水的 -螺旋中心由有6個反向平行的 -螺旋圍繞著形成(圖1-3)。有研究認為Domain I會與毒素寡發(fā)生聚化、插入細胞膜以及空洞形成有關(guān)[31],在Domain Ⅱ中是由三個反向平行的β-折疊構(gòu)成一個β棱柱( -prism)結(jié)構(gòu)(圖1-3)[30],其中兩個折疊片暴露在外側(cè)表面的而且是由希臘鑰匙的四條單鏈組成的。這種結(jié)構(gòu)被形象地稱為“Greek Key”拓撲結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)由由四個反向平行的 -折疊片段構(gòu)成。還發(fā)現(xiàn)與幼蟲中腸蛋白的特異結(jié)合有關(guān)是暴露在外面的Loop區(qū)域[31]。近年來有研究表明,某些氨基酸的位點或區(qū)域與殺蟲特異性有很大的關(guān)系是因為Cry蛋白的DomainⅡ結(jié)構(gòu)上的Cry毒素結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)。Cry毒素結(jié)構(gòu)是DomainⅡ中變化最多的結(jié)構(gòu)域[32],DomainⅡ的該區(qū)域與免疫球蛋白的相似性足可以表明毒素蛋白的DomainⅡ區(qū)域在與受體結(jié)合中起著非常重要的作用[30]
Bt BJH500 Bt BJH498圖 3-1 光學(xué)顯微鏡下蘇云金芽胞桿菌的晶體形態(tài)Fig. 3-1 The crystal shape of Bt strains under a microcope3.2 標(biāo)準(zhǔn)菌株基因組提取對從海南地區(qū)篩選出的 755 株標(biāo)準(zhǔn)菌株進行基因組的提取,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測如圖 3-2。從電泳結(jié)果圖中可以看出,提取的基因組質(zhì)量和濃度較高,將提取質(zhì)量高的基因組作為模板用于后續(xù) PCR 擴增實驗。
【參考文獻】
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本文編號:2757422
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