大豆lox2基因表達方式分析及其啟動子預(yù)測
發(fā)布時間:2020-06-17 00:11
【摘要】:在不同逆境脅迫、激素條件下,檢測大豆各器官中l(wèi)ox2基因表達方式,并對其啟動子的序列及功能進行預(yù)測。利用qPT-PCR方法,檢測大豆lox2基因表達方式;此外,通過PCR方法,克隆獲得大豆lox2基因5’端上游序列,利用啟動子在線軟件進行預(yù)測分析。結(jié)果表明,該基因受干旱誘導(dǎo),誘導(dǎo)表達量隨處理時間增強;在鹽、低溫、ABA條件處理下,誘導(dǎo)表達下降,下降的表達量不隨處理時間而變化。大豆lox2基因在大豆根、莖、葉、花中的相對表達量低,而在種子中的相對表達量高。克隆獲得大豆lox2基因5’端上游2016 bp序列,命名為LP。在線軟件預(yù)測分析,表明LP序列中含有多種典型的種子特異表達元件,如SEF3motif、SEF4motif、E-box、AACACA、ACGT、Skn-1 motif、AATAAA等;及與逆境、激素誘導(dǎo)相關(guān)的元件,如LTR、MBS、W-box、AAAG-motif、ABRE等。推測大豆LP啟動子具有調(diào)控下游基因大量表達在種子中的特性,同時具有受脫落酸及其它逆境誘導(dǎo)表達的特性。
【圖文】:
2、5、10和24h處理時間下,相對表達量與處理1h的表達量變化不大(圖2)。大豆lox2基因在低溫、ABA條件處理下,表現(xiàn)出與鹽處理條件下相似的規(guī)律(圖3~4)。說明大豆lox2基因受鹽、低溫、ABA9876543210相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖1干旱脅迫下lox2基因的表達Fig.1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖2鹽脅迫下lox2基因的表達Fig.2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖3低溫脅迫下lox2基因的表達Fig.3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖4ABA誘導(dǎo)lox2基因的表達Fig.4Expressionoflox2geneunderABAinduction誘導(dǎo),誘導(dǎo)表達下降,下降的表達量不隨處理時間而變化。2.2大豆lox2基因的器官表達分析利用qRT-PCR方法,大豆持家基因β-tubulin為內(nèi)參,對大豆根、莖、葉、花、未成熟種子和成熟種子中l(wèi)ox2基因的相對表達量進行分析。結(jié)果顯示(圖相對定量Relative%quantity時間(h)160140120100806040200根莖葉花種子(30DAF)種子(90DAF)圖5大豆lox2基因在大豆各器官中的表達Fig.5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM.2000bpDNAma
2、5、10和24h處理時間下,相對表達量與處理1h的表達量變化不大(圖2)。大豆lox2基因在低溫、ABA條件處理下,表現(xiàn)出與鹽處理條件下相似的規(guī)律(圖3~4)。說明大豆lox2基因受鹽、低溫、ABA9876543210相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖1干旱脅迫下lox2基因的表達Fig.1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖2鹽脅迫下lox2基因的表達Fig.2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖3低溫脅迫下lox2基因的表達Fig.3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖4ABA誘導(dǎo)lox2基因的表達Fig.4Expressionoflox2geneunderABAinduction誘導(dǎo),誘導(dǎo)表達下降,下降的表達量不隨處理時間而變化。2.2大豆lox2基因的器官表達分析利用qRT-PCR方法,大豆持家基因β-tubulin為內(nèi)參,對大豆根、莖、葉、花、未成熟種子和成熟種子中l(wèi)ox2基因的相對表達量進行分析。結(jié)果顯示(圖相對定量Relative%quantity時間(h)160140120100806040200根莖葉花種子(30DAF)種子(90DAF)圖5大豆lox2基因在大豆各器官中的表達Fig.5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM.2000bpDNAma
【圖文】:
2、5、10和24h處理時間下,相對表達量與處理1h的表達量變化不大(圖2)。大豆lox2基因在低溫、ABA條件處理下,表現(xiàn)出與鹽處理條件下相似的規(guī)律(圖3~4)。說明大豆lox2基因受鹽、低溫、ABA9876543210相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖1干旱脅迫下lox2基因的表達Fig.1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖2鹽脅迫下lox2基因的表達Fig.2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖3低溫脅迫下lox2基因的表達Fig.3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖4ABA誘導(dǎo)lox2基因的表達Fig.4Expressionoflox2geneunderABAinduction誘導(dǎo),誘導(dǎo)表達下降,下降的表達量不隨處理時間而變化。2.2大豆lox2基因的器官表達分析利用qRT-PCR方法,大豆持家基因β-tubulin為內(nèi)參,對大豆根、莖、葉、花、未成熟種子和成熟種子中l(wèi)ox2基因的相對表達量進行分析。結(jié)果顯示(圖相對定量Relative%quantity時間(h)160140120100806040200根莖葉花種子(30DAF)種子(90DAF)圖5大豆lox2基因在大豆各器官中的表達Fig.5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM.2000bpDNAma
2、5、10和24h處理時間下,相對表達量與處理1h的表達量變化不大(圖2)。大豆lox2基因在低溫、ABA條件處理下,表現(xiàn)出與鹽處理條件下相似的規(guī)律(圖3~4)。說明大豆lox2基因受鹽、低溫、ABA9876543210相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖1干旱脅迫下lox2基因的表達Fig.1Expressionoflox2geneunderdroughtstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖2鹽脅迫下lox2基因的表達Fig.2Expressionoflox2geneundersaltstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖3低溫脅迫下lox2基因的表達Fig.3Expressionoflox2geneundercoldstress1111000相對定量Relative%quantity0%1%2%510%24時間(h)圖4ABA誘導(dǎo)lox2基因的表達Fig.4Expressionoflox2geneunderABAinduction誘導(dǎo),誘導(dǎo)表達下降,下降的表達量不隨處理時間而變化。2.2大豆lox2基因的器官表達分析利用qRT-PCR方法,大豆持家基因β-tubulin為內(nèi)參,對大豆根、莖、葉、花、未成熟種子和成熟種子中l(wèi)ox2基因的相對表達量進行分析。結(jié)果顯示(圖相對定量Relative%quantity時間(h)160140120100806040200根莖葉花種子(30DAF)種子(90DAF)圖5大豆lox2基因在大豆各器官中的表達Fig.5Expressionofsoybeanlox2geneindifferentsoybeanorgansM%12000%bp1000%bp750%bp500%bp250%bp100%bp2016%bpM.2000bpDNAma
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9 郭
本文編號:2716790
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