木薯糖轉(zhuǎn)運蛋白家族基因全基因組鑒定和功能分析
發(fā)布時間:2020-06-01 11:27
【摘要】:植物糖轉(zhuǎn)運蛋白主要介導(dǎo)糖類物質(zhì)的運輸活動,參與“源庫”組織間碳水化合物的裝載同卸載,在植物生長發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用。木薯是重要的塊根類作物,塊根數(shù)目和塊根淀粉含量是其產(chǎn)量的關(guān)鍵指標(biāo)。研究糖轉(zhuǎn)運蛋白基因?qū)馕瞿臼淼奶切遁d途徑、塊根發(fā)生和淀粉積累過程具有重要意義。本研究采用生物信息學(xué)手段對木薯糖轉(zhuǎn)運蛋白進(jìn)行了全基因組鑒定、基因結(jié)構(gòu)與蛋白結(jié)構(gòu)域分析、系統(tǒng)進(jìn)化分析、共線性分析等;通過Real-time PCR技術(shù),分析了糖轉(zhuǎn)運蛋白STP(sugar transporter)和SUT(sucrose transporter)基因家族成員在木薯不同組織部位、不同發(fā)育時期的表達(dá)模式;通過木薯原生質(zhì)體瞬時表達(dá)體系和酵母突變體功能互補實驗,對16個木薯STPs進(jìn)行了亞細(xì)胞定位分析和功能驗證。主要結(jié)論如下:(1)木薯中共有69個負(fù)責(zé)單糖和蔗糖運輸?shù)霓D(zhuǎn)運蛋白,在聚類分析上,它們可以歸為8個亞家族,其中STP亞家族有20個成員、SFP亞家族有15個成員、PLT亞家族有10個成員、TMT和pGlcT亞家族各有6個成員、SUT和INT亞家族分別有5個成員、VGT亞族有2個成員。各亞族內(nèi)成員在基因結(jié)構(gòu)上、蛋白結(jié)構(gòu)域上均較為保守,但各亞族間的成員卻存在較大差異;驈(fù)制事件分析表明,相對于串聯(lián)復(fù)制,全基因組復(fù)制或片段性復(fù)制是糖轉(zhuǎn)運蛋白成員數(shù)目增多的主要機(jī)制。復(fù)制基因間的進(jìn)化選擇壓均為純化選擇,且復(fù)制基因之間存在去功能化、亞功能化和新功能化三種現(xiàn)象,其中去功能化最為明顯。(2)糖轉(zhuǎn)運蛋白基因在木薯不同組織部位和發(fā)育時期上的表達(dá)表現(xiàn)出較大的時空特異性:在木薯的芽頂端分生組織中,MeSTP2和MeSUT4表達(dá)量最高;在葉中,MeSTP17和MeSUT5表達(dá)量最高;在側(cè)芽中,MeSTP2和MeSUT4表達(dá)量最高;在莖中,表達(dá)量最高的基因分別是MeSTP/7和MeSUT5;在須根中,MeSTP19和MeSUT5表達(dá)量最高;在塊根中,MeSP2和MeSUT3表達(dá)量最高;在根尖分生組織中,MeSTP7和MeSUT1有著較高豐度的表達(dá)。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),STPs和SUTs基因在發(fā)育早期(60-90天)的塊根中表達(dá)量最高,并且,隨著塊根發(fā)育成熟,這些基因的表達(dá)量逐漸降低。此外,在生長30-51天的木薯塊根中,幾乎所有的MeSTPs基因在30-40天的塊根中表達(dá)量最高,而在生長45-51天的塊根中,這些基因的表達(dá)量均表現(xiàn)出下降趨勢。(3)從木薯中克隆出來的16個STP基因,在酵母突變體上進(jìn)行功能互補實驗,觀察酵母在甘露糖、半乳糖、木糖、葡萄糖、果糖上的生長情況。結(jié)果表明:MeSTP2、MeSTP19對5種單糖均有比較強的轉(zhuǎn)運能力;MeSTP3、MeSTP5和MeSTP16表現(xiàn)出對半乳糖特異性轉(zhuǎn)運,但轉(zhuǎn)運能力較弱;MeSTP8、MeSTP10和MeSTPl1對5種單糖均表現(xiàn)出較弱的轉(zhuǎn)運能力;MeSTP7、MeSTP12和MeSTP17主要對甘露糖、半乳糖、葡萄糖和果糖有著較強的轉(zhuǎn)運能力;MeSTP4、MeSTP10、MeSTP13、MeSTP14和MeSTP20對5種單糖均無轉(zhuǎn)運能力;此外木薯STP在木薯原生質(zhì)體亞細(xì)胞定位結(jié)果確定所有的MeSTPs均為定位于細(xì)胞膜上。綜上所述,木薯上有著數(shù)目眾多的糖轉(zhuǎn)運蛋白基因,它們廣泛的參與木薯各個組織上的糖運輸活動;MeSTP和MeSUT基因在木薯塊根發(fā)育過程的表達(dá)模式暗示了木薯的糖卸載途徑經(jīng)過了由質(zhì)外體途徑向共質(zhì)體轉(zhuǎn)化的過程;MeSTPs為細(xì)胞膜定位蛋白,大多數(shù)成員對單糖底物有著廣譜性轉(zhuǎn)運特性,它們在木薯塊根發(fā)生早期,主要負(fù)責(zé)將質(zhì)外體單糖向膜內(nèi)的運輸活動,其可能參與了木薯須根向塊根轉(zhuǎn)化的這一重要活動。本研究對闡明糖轉(zhuǎn)運蛋白在木薯的塊根發(fā)生過程中的生物學(xué)功能具有重要意義,也為木薯的品種改良提供理論依據(jù)和候選基因資源。
【圖文】:
1.1.1糖類物質(zhì)在植物體內(nèi)的合成代謝逡逑植物通過光合作用產(chǎn)生的糖類物質(zhì),是植物體賴以生存的基本營養(yǎng)成分。物質(zhì)除了可以進(jìn)行營養(yǎng)代謝外,它還具有多種其它功能,如作為前體參與脂類基酸以及其它次級代謝產(chǎn)物的合成、作為植物滲透勢的調(diào)節(jié)物、此外可以作號分子,參與調(diào)控植物體的多種生理生化活動。糖類物質(zhì)在植物體內(nèi)的運輸配,很大程度上影響著植物的生長、發(fā)育、代謝以及果實的品質(zhì)及產(chǎn)量。在中,主要的可溶性糖有蔗糖,葡萄糖,果糖。逡逑植物合成糖類物質(zhì)的場所是在葉片中的葉綠體上,主要經(jīng)歷了兩個階段(-1)。第一階段稱之為“光反應(yīng)”,葉綠素在吸收光子后,產(chǎn)生高能電子,隨過電子傳遞鏈,產(chǎn)生質(zhì)子梯度,,最終合成煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷(triphosphopyridine邋nucleotide邋,邋NADPH)和腺嘌呤核苷三磷酸(adenosintriphosphate,邋ATP);邋“暗反應(yīng)”階段是利用“光反應(yīng)”的產(chǎn)物來“捕捉”(:02,通過“卡爾文”循環(huán),合成磷酸丙糖。部分磷酸丙糖在葉綠體中被合成淀粉,逡逑以暫時It藏。大部分的a愃岜潛籥愃岜親俗櫻ǎ裕潁椋錚螅邋澹校瑁錚螅穡瑁幔簦澹恚睿螅歟錚悖幔簦錚潁澹裕校裕┦涑齙較赴手,染忬哉浕媳I械拿復(fù)俜從ο陸釁淥譴。辶x希停澹螅錚瑁悖澹櫻牛茫緬義
本文編號:2691417
【圖文】:
1.1.1糖類物質(zhì)在植物體內(nèi)的合成代謝逡逑植物通過光合作用產(chǎn)生的糖類物質(zhì),是植物體賴以生存的基本營養(yǎng)成分。物質(zhì)除了可以進(jìn)行營養(yǎng)代謝外,它還具有多種其它功能,如作為前體參與脂類基酸以及其它次級代謝產(chǎn)物的合成、作為植物滲透勢的調(diào)節(jié)物、此外可以作號分子,參與調(diào)控植物體的多種生理生化活動。糖類物質(zhì)在植物體內(nèi)的運輸配,很大程度上影響著植物的生長、發(fā)育、代謝以及果實的品質(zhì)及產(chǎn)量。在中,主要的可溶性糖有蔗糖,葡萄糖,果糖。逡逑植物合成糖類物質(zhì)的場所是在葉片中的葉綠體上,主要經(jīng)歷了兩個階段(-1)。第一階段稱之為“光反應(yīng)”,葉綠素在吸收光子后,產(chǎn)生高能電子,隨過電子傳遞鏈,產(chǎn)生質(zhì)子梯度,,最終合成煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷(triphosphopyridine邋nucleotide邋,邋NADPH)和腺嘌呤核苷三磷酸(adenosintriphosphate,邋ATP);邋“暗反應(yīng)”階段是利用“光反應(yīng)”的產(chǎn)物來“捕捉”(:02,通過“卡爾文”循環(huán),合成磷酸丙糖。部分磷酸丙糖在葉綠體中被合成淀粉,逡逑以暫時It藏。大部分的a愃岜潛籥愃岜親俗櫻ǎ裕潁椋錚螅邋澹校瑁錚螅穡瑁幔簦澹恚睿螅歟錚悖幔簦錚潁澹裕校裕┦涑齙較赴手,染忬哉浕媳I械拿復(fù)俜從ο陸釁淥譴。辶x希停澹螅錚瑁悖澹櫻牛茫緬義
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