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BSR-Seq技術(shù)對K型溫敏CMS恢復(fù)基因RfK1的精細(xì)定位和候選基因功能預(yù)測

發(fā)布時間:2020-05-18 20:50
【摘要】:試驗以小麥溫敏細(xì)胞質(zhì)雄性不育系KTP116A,其同型保持系TP116B,及其恢復(fù)系LK783為材料,采用SSR分子標(biāo)記、BSR-Seq分析、KASP標(biāo)記等方法對細(xì)胞質(zhì)雄性不育的育性恢復(fù)基因Rfk1進(jìn)行定位,利用比較基因組學(xué)和測序手段,尋找和開發(fā)與恢復(fù)基因緊密連鎖的分子標(biāo)記,并根據(jù)基因注釋預(yù)測候選基因功能。為小麥K型雄性不育育性恢復(fù)的遺傳機理的探索提供理論基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下:1.對兩種供試材料KTP116A、LK783,進(jìn)行花粉粒制片觀察(K-I_2染色和醋酸洋紅染色),并對供試材料的三核期的花藥形態(tài)、內(nèi)壁、外壁以及小孢子做掃描電鏡觀察。結(jié)果表明:KTP116A的敗育類型為染敗,其花藥末端不開裂;外壁排列紊亂;二核期小孢子萎縮和畸形。對回交后代作圖群體進(jìn)行小孢子育性鑒定發(fā)現(xiàn):回交分離群體不育株與可育株接近1:3的分離比例,由此推測LK783上能夠恢復(fù)其小孢子育性的基因為兩個。2.恢復(fù)系LK783與保持系TP116B雜交再與不育系KTP116A回交得到的BC_1F_1群體,測回交群體單株結(jié)實率并進(jìn)行統(tǒng)計分析。結(jié)果表明:不育系TP116A為配子體不育;不育系KTP116A的育性恢復(fù)受LK783上的兩對主效恢復(fù)基因控制。并通過對群體的SSR標(biāo)記分析找出了兩對可靠的分子標(biāo)記Xgwm413和Xbarc137,遺傳距離分別為1.5cM和2.1cM,又根據(jù)(劉保申等2006)的研究結(jié)果把Rfk1定位在了Xgwm413和Xgwm264之間,遺傳距離為分別為1.5cM和5.7cM的區(qū)間內(nèi)。3.通過對作圖群體的BSR-Seq分析,發(fā)掘與不育相關(guān)的SNP位點;同時在親本和作圖群體上對相關(guān)SNP進(jìn)行KASP分型檢測,找出在親本之間存在多態(tài)性的標(biāo)記并利用這些標(biāo)記在分離群體上對Rfk1精細(xì)定位。試驗通過親本篩選,共篩選出31對具有多態(tài)性的KASP標(biāo)記,再通過分離群體篩選總共獲得了八對相關(guān)的KASP標(biāo)記,其中有兩個標(biāo)記與Rfk1疑似共分離,分別命名為G29121341A和A40269228G。然后把這些標(biāo)記依次對應(yīng)在SNP index物理圖譜上,最終把Rfk1定位在標(biāo)記G29121341A和A40269228G之間共10MB的區(qū)間內(nèi)。4.通過篩選出的KASP標(biāo)記對118個恢復(fù)系、13個不育系、其他不育材料3個回交群體的139個單株進(jìn)行分型分析,開發(fā)出了KASP標(biāo)記A40269228G。根據(jù)Ensembl Plants網(wǎng)站上的基因注釋信息對候選SNP所在基因進(jìn)行功能預(yù)測,找到了兩個候選基因及其注釋,其基因ID為Traes_1BS_D837C1ADC與Traes_1BS_51DD23078。
【圖文】:

碘化鉀,掃描電鏡圖,小孢子,可育


且端部存在開裂現(xiàn)象(圖 2-3 e),其花藥的末端出現(xiàn)了不同程度的分叉(圖 2-3 e)花外壁排列十分整齊(圖 2-3 i);小孢子圓潤飽滿(圖 2-3 b c)。圖 2-2 群體 KTP116A//LK783/TP116B 的各級可育小孢百分比單株統(tǒng)計igure 3 - 2 percentage of viable microspores at each stage of KTP 116A/ / LK 783 / TP 116B populati8910392412627514336100542040204060801001201級 2級 3級 4級 5級 6級 7級 8級 9級 10級 11級 12級 13級

標(biāo)記檢測,細(xì)胞質(zhì)雄性不育系,遺傳分析,第三


.四種K型CMS的BC1F1群體育性統(tǒng)計
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S512.1

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2670293

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