條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因PsG6PDH1的表達(dá)特征及功能分析
發(fā)布時(shí)間:2020-02-05 10:19
【摘要】:葡萄糖-6-磷酸脫氫酶是磷酸戊糖途徑中的關(guān)鍵限速酶;谝褱y(cè)序的條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型基因組序列,利用RT-PCR方法克隆了該病菌葡萄糖-6-磷酸脫氫酶PsG6PDH1的全長(zhǎng)cDNA序列(1 497bp),編碼498個(gè)氨基酸的蛋白。編碼蛋白含有葡萄糖-6-磷酸脫氫酶的保守功能域。系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),PsG6PDH1與禾柄銹菌小麥專(zhuān)化型的G6PDH聚為一簇。qRT-PCR分析表明,PsG6PDH1在病菌侵染早期的表達(dá)明顯上調(diào),其中侵染24h時(shí)表達(dá)量最高,為對(duì)照夏孢子的30倍。將PsG6PDH1導(dǎo)入釀酒酵母G6PDH缺失突變體中成功表達(dá),并表現(xiàn)出較強(qiáng)的葡萄糖-6-磷酸脫氫酶活性,明顯酵母增強(qiáng)了菌株對(duì)過(guò)氧化氫的耐受性。由此推測(cè),PsG6PDH1可能參與了條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型在侵染寄主時(shí)抵御寄主的氧化脅迫反應(yīng)。研究結(jié)果為進(jìn)一步研究該病菌基礎(chǔ)代謝及侵染機(jī)理奠定一定的理論基礎(chǔ)。
【圖文】:
王秋玲等/條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型葡萄糖 6 磷酸脫氫酶基因PsG6PDH1的表達(dá)特征及功能分析菌物學(xué)報(bào)1203果進(jìn)行分析獲得PsG6PDH1基因序列,,經(jīng)ORFFinder預(yù)測(cè),該基因含有1497bp的ORF。提取病菌CYR32萌發(fā)的夏孢子的RNA,合成cDNA第一鏈為模板,利用引物G6PDH F/G6PDH R進(jìn)行RT PCR擴(kuò)增,回收目標(biāo)片段,并克壟測(cè)序(圖1),測(cè)序結(jié)果與基因組公布序列一致。圖1條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1cDNA的擴(kuò)增及克隆驗(yàn)證A:RT PCR擴(kuò)增PsG6PDH1cDNA;B:重組質(zhì)粒pMD18 Tsimple PsG6PDH1的雙酶切(XhoⅠ/KpnⅠ)鑒定.Fig.1AmplificationandcloningofPsG6PDH1cDNAfromPucciniastriiformis.A:AmplificationofthePsG6PDH1cDNAusingRT PCR;B:IdentificationoftherecombinantplasmidpMD18 Tsimple PsG6PDH1byrestrictiondigestionwithXhoⅠ/KpnⅠ.ProtParam軟件預(yù)測(cè)PsG6PDH1基因編碼498個(gè)氨基酸,分子量大小為56.59kDa,等電點(diǎn)為8.54。利用Pfam對(duì)目的蛋白的結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示該蛋白中含有葡萄糖六磷酸脫氫酶保守功能域(圖2A),一個(gè)NAD(P)結(jié)合域(第15 205位氨基酸),一個(gè)葡萄糖六磷酸脫氫酶激活位點(diǎn)(192 198位氨基酸)。為進(jìn)一步明確PsG6PDH1與其他真菌G6PDH蛋白的進(jìn)化關(guān)系,從BLASTP搜索的PsG6PDH1同源蛋白并選擇了12個(gè)來(lái)自擔(dān)子菌門(mén)和子囊菌門(mén)真菌的G6PDH蛋白序列,利用ClustalW1.83進(jìn)行同源性比對(duì)。結(jié)果顯示,PsG6PDH1與禾柄銹菌小麥專(zhuān)化型P.graminisf.sp.triticiCRL75 36 700 3的G6PDH同源性最高,相似性達(dá)到95%;與青楊葉銹菌Melampsoralarici populina98AG31的G6PDH相似性達(dá)到86%,但與釀酒酵母S.cerevisiaeS288c的G6PDH的相似性?xún)H為54%。通過(guò)MEGA5.1軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖2B),結(jié)果表明,PsG
隆驗(yàn)證A:RT PCR擴(kuò)增PsG6PDH1cDNA;B:重組質(zhì)粒pMD18 Tsimple PsG6PDH1的雙酶切(XhoⅠ/KpnⅠ)鑒定.Fig.1AmplificationandcloningofPsG6PDH1cDNAfromPucciniastriiformis.A:AmplificationofthePsG6PDH1cDNAusingRT PCR;B:IdentificationoftherecombinantplasmidpMD18 Tsimple PsG6PDH1byrestrictiondigestionwithXhoⅠ/KpnⅠ.ProtParam軟件預(yù)測(cè)PsG6PDH1基因編碼498個(gè)氨基酸,分子量大小為56.59kDa,等電點(diǎn)為8.54。利用Pfam對(duì)目的蛋白的結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示該蛋白中含有葡萄糖六磷酸脫氫酶保守功能域(圖2A),一個(gè)NAD(P)結(jié)合域(第15 205位氨基酸),一個(gè)葡萄糖六磷酸脫氫酶激活位點(diǎn)(192 198位氨基酸)。為進(jìn)一步明確PsG6PDH1與其他真菌G6PDH蛋白的進(jìn)化關(guān)系,從BLASTP搜索的PsG6PDH1同源蛋白并選擇了12個(gè)來(lái)自擔(dān)子菌門(mén)和子囊菌門(mén)真菌的G6PDH蛋白序列,利用ClustalW1.83進(jìn)行同源性比對(duì)。結(jié)果顯示,PsG6PDH1與禾柄銹菌小麥專(zhuān)化型P.graminisf.sp.triticiCRL75 36 700 3的G6PDH同源性最高,相似性達(dá)到95%;與青楊葉銹菌Melampsoralarici populina98AG31的G6PDH相似性達(dá)到86%,但與釀酒酵母S.cerevisiaeS288c的G6PDH的相似性?xún)H為54%。通過(guò)MEGA5.1軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖2B),結(jié)果表明,PsG6PDH1與擔(dān)子菌門(mén)的禾柄銹菌小麥專(zhuān)化型P.graminisf.sp.tritici、青楊葉銹菌Melampsoralarici populina、玉米瘤黑粉Ustilagomaydis、裂褶菌Schizophyllumcommune的G6PDH蛋白聚為一類(lèi);而子囊菌門(mén)真菌的G6PDH聚為一類(lèi),表明PsG6PDH1與來(lái)自擔(dān)子菌門(mén)的真菌的G6PDH圖2條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)及系統(tǒng)進(jìn)化分析A:條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1蛋白的結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè);B:條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1與其他真
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【圖文】:
王秋玲等/條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型葡萄糖 6 磷酸脫氫酶基因PsG6PDH1的表達(dá)特征及功能分析菌物學(xué)報(bào)1203果進(jìn)行分析獲得PsG6PDH1基因序列,,經(jīng)ORFFinder預(yù)測(cè),該基因含有1497bp的ORF。提取病菌CYR32萌發(fā)的夏孢子的RNA,合成cDNA第一鏈為模板,利用引物G6PDH F/G6PDH R進(jìn)行RT PCR擴(kuò)增,回收目標(biāo)片段,并克壟測(cè)序(圖1),測(cè)序結(jié)果與基因組公布序列一致。圖1條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1cDNA的擴(kuò)增及克隆驗(yàn)證A:RT PCR擴(kuò)增PsG6PDH1cDNA;B:重組質(zhì)粒pMD18 Tsimple PsG6PDH1的雙酶切(XhoⅠ/KpnⅠ)鑒定.Fig.1AmplificationandcloningofPsG6PDH1cDNAfromPucciniastriiformis.A:AmplificationofthePsG6PDH1cDNAusingRT PCR;B:IdentificationoftherecombinantplasmidpMD18 Tsimple PsG6PDH1byrestrictiondigestionwithXhoⅠ/KpnⅠ.ProtParam軟件預(yù)測(cè)PsG6PDH1基因編碼498個(gè)氨基酸,分子量大小為56.59kDa,等電點(diǎn)為8.54。利用Pfam對(duì)目的蛋白的結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示該蛋白中含有葡萄糖六磷酸脫氫酶保守功能域(圖2A),一個(gè)NAD(P)結(jié)合域(第15 205位氨基酸),一個(gè)葡萄糖六磷酸脫氫酶激活位點(diǎn)(192 198位氨基酸)。為進(jìn)一步明確PsG6PDH1與其他真菌G6PDH蛋白的進(jìn)化關(guān)系,從BLASTP搜索的PsG6PDH1同源蛋白并選擇了12個(gè)來(lái)自擔(dān)子菌門(mén)和子囊菌門(mén)真菌的G6PDH蛋白序列,利用ClustalW1.83進(jìn)行同源性比對(duì)。結(jié)果顯示,PsG6PDH1與禾柄銹菌小麥專(zhuān)化型P.graminisf.sp.triticiCRL75 36 700 3的G6PDH同源性最高,相似性達(dá)到95%;與青楊葉銹菌Melampsoralarici populina98AG31的G6PDH相似性達(dá)到86%,但與釀酒酵母S.cerevisiaeS288c的G6PDH的相似性?xún)H為54%。通過(guò)MEGA5.1軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖2B),結(jié)果表明,PsG
隆驗(yàn)證A:RT PCR擴(kuò)增PsG6PDH1cDNA;B:重組質(zhì)粒pMD18 Tsimple PsG6PDH1的雙酶切(XhoⅠ/KpnⅠ)鑒定.Fig.1AmplificationandcloningofPsG6PDH1cDNAfromPucciniastriiformis.A:AmplificationofthePsG6PDH1cDNAusingRT PCR;B:IdentificationoftherecombinantplasmidpMD18 Tsimple PsG6PDH1byrestrictiondigestionwithXhoⅠ/KpnⅠ.ProtParam軟件預(yù)測(cè)PsG6PDH1基因編碼498個(gè)氨基酸,分子量大小為56.59kDa,等電點(diǎn)為8.54。利用Pfam對(duì)目的蛋白的結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示該蛋白中含有葡萄糖六磷酸脫氫酶保守功能域(圖2A),一個(gè)NAD(P)結(jié)合域(第15 205位氨基酸),一個(gè)葡萄糖六磷酸脫氫酶激活位點(diǎn)(192 198位氨基酸)。為進(jìn)一步明確PsG6PDH1與其他真菌G6PDH蛋白的進(jìn)化關(guān)系,從BLASTP搜索的PsG6PDH1同源蛋白并選擇了12個(gè)來(lái)自擔(dān)子菌門(mén)和子囊菌門(mén)真菌的G6PDH蛋白序列,利用ClustalW1.83進(jìn)行同源性比對(duì)。結(jié)果顯示,PsG6PDH1與禾柄銹菌小麥專(zhuān)化型P.graminisf.sp.triticiCRL75 36 700 3的G6PDH同源性最高,相似性達(dá)到95%;與青楊葉銹菌Melampsoralarici populina98AG31的G6PDH相似性達(dá)到86%,但與釀酒酵母S.cerevisiaeS288c的G6PDH的相似性?xún)H為54%。通過(guò)MEGA5.1軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖2B),結(jié)果表明,PsG6PDH1與擔(dān)子菌門(mén)的禾柄銹菌小麥專(zhuān)化型P.graminisf.sp.tritici、青楊葉銹菌Melampsoralarici populina、玉米瘤黑粉Ustilagomaydis、裂褶菌Schizophyllumcommune的G6PDH蛋白聚為一類(lèi);而子囊菌門(mén)真菌的G6PDH聚為一類(lèi),表明PsG6PDH1與來(lái)自擔(dān)子菌門(mén)的真菌的G6PDH圖2條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)及系統(tǒng)進(jìn)化分析A:條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1蛋白的結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè);B:條形柄銹菌小麥專(zhuān)化型PsG6PDH1與其他真
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7 ;[J];;年期
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