【摘要】：從蘋果全基因組范圍內共鑒定出13個YABBY基因,通過聚類分析將其分為YAB1/YAB3、YAB2、INO、YAB5和CRC 5個亞家族。Md YABBY基因分布在蘋果的9條染色體上,在第16條染色體上分布最多。Md YABBY蛋白長度介于60~538個氨基酸,等電點為4.84~9.81,所有Md YABBY蛋白都包含有鋅指結構和YABBY兩個保守結構域,同一個亞家族內的成員表現(xiàn)出相似的基因結構和蛋白保守基序分布;基因順式作用元件分析發(fā)現(xiàn),Md YABBY基因包含許多與抗逆和激素響應有關的作用元件。基因表達分析發(fā)現(xiàn),Md YABBY基因在花、果和葉中的表達量較高,5個Md YABBY基因在果實發(fā)育的3個時期均明顯地上調表達。
[Abstract]:A total of 13 YABBY genes were identified from the whole genome of apple and divided into 5 subfamilies YAB1/YAB3,YAB2,INO,YAB5 and CRC by cluster analysis. Md YABBY gene was distributed on 9 chromosomes of apple. The maximum length of. Md YABBY protein on chromosome 16 was between 60 and 538 amino acids, and the isoelectric point was 4.84 and 9.81. All Md YABBY proteins contained two conserved domains: zinc finger structure and YABBY. The members of the same subfamily showed similar gene structure and protein conserved motif distribution. Cis-acting element analysis revealed that the, Md YABBY gene contained many elements related to stress resistance and hormone response. Gene expression analysis showed that the expression of, Md YABBY gene was higher in flowers, fruits and leaves, and the expression of 5 Md YABBY genes was up-regulated at three stages of fruit development.
【作者單位】： 西北農林科技大學園藝學院;
【基金】：國家科技支撐計劃項目(2013BAD20B03) 國家星火計劃項目(2014GA850002) 國家現(xiàn)代農業(yè)產業(yè)技術體系項目(CARS-28) 國家蘋果改良中心楊凌分中心,陜西省農業(yè)科技創(chuàng)新與攻關項目(2015NY114) 陜西省果業(yè)發(fā)展協(xié)同中心和陜西果業(yè)發(fā)展項目
【分類號】：S661.1

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