發(fā)布時間：2019-02-25 09:29

【摘要】：采用信號處理技術(shù)來識別DNA堿基序列中的基因片段的方法,已經(jīng)成為一種重要的基因識別途徑,重新編碼的DNA序列存在大量噪聲信息,使得目前很多識別算法無法準確的識別外顯子片段的起始位置。本研究通過對"固定長度滑動窗口-頻譜曲線法"和"移動序列-信噪比法"的實現(xiàn)與改進,提出了一種基于變動窗口和移動序列的基因識別算法。首先,對已有基因識別算法進行編程實現(xiàn);采用小波分析對識別結(jié)果進行消噪處理;探討識別最優(yōu)固定長度M的選擇,提出基于變動窗口和移動序列的基因預(yù)測模型,并編程實現(xiàn)。最后使用該模型對已有基因序列進行識別,其識別準確度達到77.57%。
[Abstract]:The method for identifying the gene segment in the DNA base sequence by adopting the signal processing technology has become an important gene recognition way, and the re-encoded DNA sequence has a large amount of noise information, so that the present many identification algorithms can not accurately identify the starting position of the exon fragments. Through the realization and improvement of the "fixed-length sliding window-spectrum curve method" and the "mobile sequence-to-noise ratio method", a genetic identification algorithm based on the change window and the moving sequence is proposed. First, the existing gene recognition algorithm is programmed and realized; the recognition result is de-noising by using the small wave analysis; the selection of the optimal fixed length M is discussed, and a gene prediction model based on the change window and the moving sequence is proposed, and the realization is realized. Finally, this model was used to identify the existing gene sequence, and the recognition accuracy was 77. 57%.
【作者單位】： 首都師范大學資源環(huán)境與旅游學院;首都師范大學生命科學學院;
【基金】：國家自然科學基金項目(41171335)資助
【分類號】：Q811.4

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本文編號：2430033