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剛毛檉柳ThγGCS基因克隆及表達分析

發(fā)布時間:2018-08-28 10:10
【摘要】:γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶(γGCS)是植物細胞內(nèi)谷胱甘肽(GSH)生物合成的限速酶,在植物許多的生理過程中具有重要作用。從剛毛檉柳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中分析并獲得1條剛毛檉柳γGCS基因全長c DNA序列,命名為ThγGCS。該基因全長2 121 bp,開放閱讀框為1 536 bp,編碼511個氨基酸。生物信息學分析結(jié)果表明,ThγGCS推導的氨基酸序列分別與苜蓿、大豆以及橡膠樹等具有很高的同源性;進化分析結(jié)果表明ThγGCS屬雙子葉植物γGCS亞類,同橡膠樹,芥菜等γGCS分為一組,與單子葉植物的親緣關系較遠。該蛋白質(zhì)無跨膜結(jié)構(gòu)域,但具有1個保守的GCS2結(jié)構(gòu)域,并被定位于葉綠體中,說明ThγGCS蛋白質(zhì)較穩(wěn)定,并屬于谷氨酰半胱氨酸連接酶家族。為了研究該基因在不同非生物脅迫下的應答情況,利用實時定量RT-PCR技術,分析ThγGCS在NaCl和PEG脅迫處理后不同時間、不同組織中基因的表達。結(jié)果表明,ThγGCS受NaCl、PEG誘導上調(diào)表達,推測其可能在剛毛檉柳抗旱耐鹽過程中發(fā)揮重要作用。
[Abstract]:緯-glutamyl cysteine synthase (緯 GCS) is a rate-limiting enzyme for glutathione (GSH) biosynthesis in plant cells and plays an important role in many physiological processes in plants. A full-length c DNA sequence of Tamarix chinensis 緯 GCS gene was obtained from Tamarix chinensis transcriptome database and named Th 緯 GCS.. The full-length 2 121 bp, open reading frame encodes 511 amino acids for 1 536 bp,. The results of bioinformatics analysis showed that the deduced amino acid sequences of Th 緯 GCS were highly homologous to alfalfa, soybean and Hevea, respectively, and the evolutionary analysis showed that Th 緯 GCS was a dicotyledonous plant 緯 GCS subclass, which was divided into the same group as Hevea, mustard and other 緯 GCS. The phylogenetic relationship with monocotyledonous plants is far away. The protein has no transmembrane domain, but has a conserved GCS2 domain and is located in chloroplast, indicating that the Th 緯 GCS protein is stable and belongs to the glutamyl cysteine ligase family. In order to study the response of the gene to different abiotic stresses, the expression of Th 緯 GCS in different tissues at different time after NaCl and PEG stress was analyzed by real-time quantitative RT-PCR. The results showed that the expression of Th 緯 GCS was up-regulated by NaCl,PEG, which suggested that Th 緯 GCS might play an important role in the process of drought and salt tolerance of Tamarix chinensis.
【作者單位】: 東北林業(yè)大學林木遺傳育種國家重點實驗室;
【基金】:中央高;究蒲袠I(yè)務費專項資金項目(2572014CA12) 東北林業(yè)大學大學生創(chuàng)新訓練項目(2015102251-81)共同資助
【分類號】:S793.5;Q943.2

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本文編號:2209079

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