本文選題：瑪氏骨條藻 + 轉(zhuǎn)錄組分析　； 參考：《中國海洋大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)》2017年04期

【摘要】：本研究以瑪氏骨條藻(Skeletonema marinoi)轉(zhuǎn)錄組信息為基礎(chǔ),發(fā)現(xiàn)瑪氏骨條藻中存在26個與細(xì)胞死亡相關(guān)的酶以及37個編碼這些酶的基因。這些編碼基因的序列比對結(jié)果表明,其與假微型海鏈藻(Thalassiosira pseudonana)和大洋海鏈藻(Thalassiosira oceanica)的同源基因具有較高的一致性。對這些樣品進行數(shù)字基因表達(dá)譜的差異基因分析,獲得了不同生長時期時與細(xì)胞死亡過程有關(guān)的編碼基因的差異表達(dá)數(shù)據(jù)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在穩(wěn)定期和衰亡期,與抗氧化脅迫作用相關(guān)的關(guān)鍵酶(如過氧化物酶5、銅鋅超氧化物歧化酶)、與RNA的加工與降解過程有關(guān)的功能基因(如多核糖核苷酸核苷轉(zhuǎn)移酶、5’~3’核糖核酸外切酶2)以及細(xì)胞死亡特異蛋白的基因表達(dá)量顯著高于指數(shù)期。本論文主要是通過對轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行分析得到基因轉(zhuǎn)錄組水平差異表達(dá)結(jié)果,為蛋白水平研究提供一種可能性變化趨勢和潛在數(shù)據(jù)依據(jù),同時為以后研究提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)及研究方向。本研究也為進一步探討硅藻的細(xì)胞死亡機制奠定了基礎(chǔ),也為深入理解赤潮的消亡過程提供了新的視角。
[Abstract]:Based on the transcriptional information of Skeletonema marinoi, 26 enzymes associated with cell death and 37 genes encoding these enzymes were found in this study. The sequence alignment results of these coding genes indicated that they were highly consistent with the homologous genes of Thalassiosira pseudonanaand Thalassiosira oceanica). The differentially expressed data of coding genes related to the process of cell death at different growth stages were obtained by the differential gene analysis of the digital gene expression profiles of these samples. And it turns out, in the stable period and in the decay phase, Key enzymes related to antioxidant stress (such as peroxidase 5, copper and zinc superoxide dismutase), functional genes related to the processing and degradation of RNA (e.g., polyribonucleotide ribonucleoside transferase 5 'ribonucleic acid) The gene expression of exonuclease 2) and cell death specific protein was significantly higher than that of index phase. In this paper, the results of differentially expressed gene transcriptome are obtained by analyzing the transcriptional data, which provides a possible change trend and potential data basis for protein level research. At the same time, it provides data basis and research direction for future research. This study also laid a foundation for the further study of diatom cell death mechanism and provided a new perspective for further understanding the extinction process of red tide.
【作者單位】： 中國海洋大學(xué)海洋生命學(xué)院;海洋環(huán)境與生態(tài)教育部重點實驗室;海洋國家實驗室海洋生態(tài)與環(huán)境科學(xué)功能實驗室;海洋化學(xué)理論與工程技術(shù)教育部重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(41521064) 海洋公益性行業(yè)科研專項(201205031) 山東省自然科學(xué)基金項目(ZR2014DM007)資助~~
【分類號】：Q943.2

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1950762