【摘要】：傳統(tǒng)的虛擬篩選以及網(wǎng)格環(huán)境下的虛擬篩選都需要化學(xué)家手動(dòng)將小分子文件上傳以及結(jié)果數(shù)據(jù)收集,無(wú)法實(shí)現(xiàn)自動(dòng)對(duì)接以及結(jié)果文件的自動(dòng)收集,給化學(xué)家造成了一定的工作負(fù)擔(dān)。 本論文在國(guó)家自然科學(xué)基金重大研究計(jì)劃中兩個(gè)重點(diǎn)項(xiàng)目“計(jì)算化學(xué)e-Science研究和示范應(yīng)用”以及“網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下抗禽流感病毒H5N1藥物的大規(guī)模虛擬篩選研究”成果的基礎(chǔ)上,結(jié)合Hadoop平臺(tái)在海量數(shù)據(jù)存儲(chǔ)中的優(yōu)勢(shì),開(kāi)展基于Hadoop平臺(tái)的虛擬篩選的海量數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和結(jié)果處理的設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn)工作,以實(shí)現(xiàn)虛擬篩選的自動(dòng)化。本論文主要開(kāi)展以下兩個(gè)方面的工作：一、針對(duì)大規(guī)模虛擬篩選中對(duì)海量原始小分子數(shù)據(jù)、對(duì)接結(jié)果數(shù)據(jù)和海量作業(yè)進(jìn)行管理的需求,實(shí)現(xiàn)了支持大規(guī)模虛擬篩選的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和作業(yè)管理的Hadoop平臺(tái)；二、利用MapReduce編程框架實(shí)現(xiàn)了并行分子對(duì)接和結(jié)果文件的初步處理。 本論文的研究成果為藥物開(kāi)發(fā)工作者提供了進(jìn)行大規(guī)模藥物虛擬篩選研究和海量數(shù)據(jù)管理的平臺(tái),為云環(huán)境下的藥物開(kāi)發(fā)提供了借鑒,將促進(jìn)計(jì)算化學(xué)e-science的發(fā)展。
【學(xué)位授予單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類(lèi)號(hào)】：TP333

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2551157