【摘要】：高通量測序儀產(chǎn)生大量的DNA數(shù)據(jù),FASTQ是被廣泛使用的存儲(chǔ)DNA數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)格式。對(duì)FASTQ格式的數(shù)據(jù)進(jìn)行壓縮處理,能有效地節(jié)省存儲(chǔ)空間。DSRC算法具有壓縮比高的優(yōu)點(diǎn),因此對(duì)DSRC算法進(jìn)行并行能提高壓縮FASTQ格式的DNA數(shù)據(jù)的效率�；赑threads,實(shí)現(xiàn)了并行DSRC算法。測試結(jié)果表明,當(dāng)使用4線程時(shí)加速比達(dá)到3.5。
[Abstract]:......
【作者單位】： 中國科學(xué)院軟件研究所并行軟件與計(jì)算科學(xué)實(shí)驗(yàn)室;中國科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所計(jì)算機(jī)體系結(jié)構(gòu)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廣州中國科學(xué)院軟件應(yīng)用技術(shù)研究所;
【基金】：國家“八六三”高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃基金(2012AA010903) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(61170075,61133005,61272136,61100073) 廣州市云計(jì)算技術(shù)研發(fā)與產(chǎn)業(yè)化專項(xiàng)資助
【分類號(hào)】：TP333

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