鞘酯單胞菌（sphingomonads）作為能夠降解廣泛的芳香族化合物（如各類多環(huán)芳烴）的一類細(xì)菌,具有良好的生物修復(fù)潛力。然而,細(xì)菌在環(huán)境中常常面臨高溫、干旱、鹽堿和營養(yǎng)貧乏等環(huán)境壓力,因此可能影響菌體生長和存活,導(dǎo)致污染修復(fù)效率降低。由鳥苷四（五）磷酸（guanosinetetraphosphate和guanosine pentaphosphate,統(tǒng)稱（p）ppGpp）介導(dǎo)的應(yīng)激反應(yīng)能夠協(xié)調(diào)細(xì)菌的生理代謝活動,從而保證細(xì)菌可在脅迫條件下生存。在sphingomonads中,（p）ppGpp由Rsh蛋白合成和水解。鑒于細(xì)菌的群體感應(yīng)（Quorum sensing,QS）能夠調(diào)控細(xì)菌的一系列生理活性,研究sphingomonads的rsh基因?qū)S信號分子積累的影響可為今后在惡劣環(huán)境中將sphingomonads作為降解污染物的生物材料提供理論依據(jù)。sphingomonads的QS信號分子主要為酰基高絲氨酸內(nèi)酯（acyl-homoserinelactone,AHL）。目前,對sphingomonads的rsh基因和AHL的關(guān)系的探究存在著大片空白,雖然sphingomonads的基因... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．１?（ｐ）ｐｐＧｐｐ分子結(jié)構(gòu)［１］??Ｆｉｇ?１．１?Ｔｈｅ?ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?（ｐ）ｐｐＧｐｐ??

酸基團轉(zhuǎn)移到ＧＴＰ／ＧＤＰ上，啟動（ｐ）ｐｐＧｐｐ合成＾ＳｐｏＴ主要響應(yīng)缺乏脂肪酸［６］、??鐵離子［７］和碳源［８］的情況。和ＲｅｌＡ不同，ＳｐｏＴ能把（ｐ）ｐｐＧｐｐ水解為ＧＴＰ／ＧＤＰ和焦??酸鹽，同時也具備微弱的（ｐ）ｐｐＧｐｐ合成能力（圖１．２）。??，（ＧＴＰｏｒＧＤＰ）、??〇：〇＾??ｐｐＧｐｐ?Ｚ??ｊｒ?Ｎ?ｏ?〇?〇?ｏ??（ＧＴＰ?ｏｒＣＤＰ）?＋?ＰＰ?ｏ?ｏ?〇?〇?〇??＿?〇°〇〇??〇?ｏ??圖１．２?ＲｅｌＡ／ＳｐｏＴ同源蛋白調(diào)控（ｐ）ｐｐＧｐｐ代謝的途徑［９］??Ｆｉｇ?１．２?ＲｅｌＡ／ＳｐｏＴ?ｈｏｍｏｌｏｇ?ｅｎｚｙｍｅｓ?＾ｃｏｎｔｒｏｌｌｉｎｇ?（ｐ）ｐｐＧｐｐ?ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ??除了５ｅ／ｏｐｒｏｔｅｏＺｗｃ／ｅｒ／ａ和Ｇａｗｗａｐｒｏ／ｅｏＺｗＣｅｒｆｃｒ，大部分細(xì)菌的（ｐ）ｐｐＧｐｐ濃度??是由ＲｅｌＡ／ＳｐｏＴ同源蛋白質(zhì)Ｒｓｈ調(diào)控的，Ｒｓｈ大＾由７５０個氨基酸俎成，結(jié)構(gòu)和ＳｐｏＴ??相似，同時具有合成和水解的功能。在不同菌株中，Ｒｓｈ響應(yīng)的營養(yǎng)條件具有較??大差異。在以，ｅｒａｃｏｃａｗ為ｅｃｏ／Ｗ１０］，Ａｆｙｘｏｃｏｃｃｒｏ?和５７／％加所＞＾以??ｃｏｅ／／ｃｏ／ｏｒｔｌ２］等菌中，氨基酸饑餓可以誘發(fā)應(yīng)激反應(yīng)。在ｃｒａｃｅｗｍｓ中，??僅僅是氨基酸饑餓不足以產(chǎn)生由Ｒｓｈ調(diào)控的應(yīng)激反應(yīng)，＇還需要額外的刺激因素如??礙源或氮源饑餓［１３］。ＡｆｙｃｏＭｃ／ｅｒ／麵ｍＡｅｒｃｗ／ｏｓ／ｓ在能促進(jìn)空載ｔＲＮＡ積累的絲氨酸??、■＊??羥肟酸的作用下沒有積累（ｐ）ｐｐＧ！）ｐ

Ｒｓｈ蛋白具有多個結(jié)構(gòu)域，可分為Ｎ末端結(jié)構(gòu)域和Ｃ末端結(jié)構(gòu)域［９］。Ｎ末端結(jié)??構(gòu)域由水解酶結(jié)構(gòu)域（ＨＤ）和合成酶結(jié)構(gòu)域（Ｓｙｎ）組成，Ｃ末端結(jié)構(gòu)域由ＴＧＳ??結(jié)構(gòu)域和ＡＣＴ結(jié)構(gòu)域組成（圖１．３）。??Ｈｙｄｒｏｌａｓｅ?（ＨＤ）?Ｓｙｎｔｈｅｔａｓｅ?（Ｓｙｎ??ＨＤ１?ＨＤ２?ＨＤ３?ＨＤ４?ＨＤ５?ＨＤ６?Ｓｙｎ１?Ｓｙｎ２?Ｓｙｎ３?Ｓｙｎ４?Ｓｙｎ５??５３Ｈ?７７ＨＤ?８１ＥＤ１４４ＤＲ／Ｋ１４８Ｎ?２４１ＲｘＫｘｘｘＳｘｘｘＫ?２６４ＤｘｘｘｘＲ?３０８ＹｘｘｘＨ?３２１ＥｘＱＩＲＴ??１２?３?４?５?６?１?２?３?４５??Ｗ＼／?＼／?ｌｌ?ＩＩ／??ｒｓｈ?；?ａｎ?ｉ?ｉ?ｒｉｉ?ｍｉ?＿?現(xiàn)＿ｉ??ＲｅｌＡ?；?ｌ?ＩＩ?Ｍｉｌ?ｉ?ｉ?＼?＼?１１?１??ＳｐｏＴ?ａｎ?ｎ?ｉｉ?ｍ！??圖１．３ＲｅｌＡ／ＳｐｏＴ同源蛋白的結(jié)構(gòu)域和催化模體??Ｆｉｇ?１．３?Ｄｏｍａｉｎ?ａｒｃｈｉｔｅｃｔｕｒｅ?ａｎｄ?ｃａｔａｌｙｔｉｃ?ｍｏｔｉｆｓ?ｏｆ?ＲｅｌＡ／ＳｐｏＴ?ｈｏｍｏｌｏｇ?ｅｎｚｙｍｅｓ??Ｒｓｈ、ＲｅｌＡ、ＳｐｏＴ都具有Ｓｙｎ結(jié)構(gòu)域，其中包含５個保守的模體（Ｓｙｎｌ－５）。??Ｓｙｎｌ與ＡＴＰ底物互相作用，Ｓｙｎ２的天冬氨酸和精氨酸分別與鎂離子和ＡＴＰ作用，??Ｓｙｎ３的酪氨酸和組氨酸和ＧＤＰ／ＧＴＰ的鳥嘌呤部分作用，Ｓｙｎ４的谷氨酸和鎂離子??作用，同時谷氨酸有助于ＡＴＰ結(jié)合，Ｓｙｎ５的組氨酸則和ＡＴＰ的核糖部分互相作用。??Ｒｓｈ和ＳｐｏＴ具有ＨＤ結(jié)構(gòu)域，而ＲｅｌＡ缺乏ＨＤ結(jié)構(gòu)域，因此沒有水解活性。??ＨＤ結(jié)構(gòu)域是一個依賴金屬離子的磷酸水解酶結(jié)構(gòu)域

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]枯草芽孢桿菌的群體感應(yīng)信號系統(tǒng)及其在環(huán)境領(lǐng)域的應(yīng)用前景[J]. 陳瑞,王大力,林志芬,尹大強.  安全與環(huán)境學(xué)報. 2012(06)



本文編號：3571375