高通量測序技術(shù)研究遼河真核浮游藻類的群落結(jié)構(gòu)特征
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【摘要】:真核浮游藻類在河流生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮著重要生態(tài)功能,本研究對遼河水環(huán)境樣本的18S rRNA基因的V4可變區(qū)進(jìn)行454焦磷酸測序,對獲得的OTU代表性序列進(jìn)行物種注釋.比較注釋后的生物種類信息與光學(xué)顯微鏡觀察結(jié)果的異同,并將OTUs的代表性序列與NCBI中真核浮游藻類的18S rRNA基因序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,此外研究了真核浮游藻類群落結(jié)構(gòu)特征及其環(huán)境影響指標(biāo).研究共獲得約167 901條18S rRNA基因V4可變區(qū)的高質(zhì)量序列,注釋為424個OTUs,涵蓋了134種真核浮游藻類OTUs.與光學(xué)顯微鏡鑒別結(jié)果類似,高通量測序結(jié)果以硅藻門和綠藻門為優(yōu)勢類群,此外檢測到輪藻門、隱藻門、定鞭藻門和金藻綱等顯微鏡觀察結(jié)果中未有的類群.系統(tǒng)發(fā)育分析可在門這一分類階元對隱藻門和甲藻門聚類,并將隱藻門在屬水平進(jìn)行聚類和區(qū)分,甲藻門可以在部分科或?qū)偎骄垲惡蛥^(qū)分.RDA結(jié)果顯示,氨氮、活性磷和硝態(tài)氮是影響真核浮游藻類群落結(jié)構(gòu)特征最重要的環(huán)境因子.本研究為認(rèn)識遼河水環(huán)境中真核浮游藻類的多樣性、群落結(jié)構(gòu)及其環(huán)境影響因子提供了新的視角,同時也預(yù)示著高通量測序技術(shù)在遼河流域浮游植物監(jiān)測和水環(huán)境質(zhì)量指示中的應(yīng)用潛力.
【作者單位】: 遼寧大學(xué)環(huán)境學(xué)院;中國環(huán)境科學(xué)研究院環(huán)境基準(zhǔn)與風(fēng)險評估國家重點(diǎn)實驗室;中國環(huán)境科學(xué)研究院流域水生態(tài)保護(hù)技術(shù)研究室;
【基金】:國家水體污染控制與治理科技重大專項(2012ZX07501-001-04)
【分類號】:Q948.8;X143
【正文快照】: 環(huán)境科學(xué)研究院流域水生態(tài)保護(hù)技術(shù)研究室,北京100012)遼河流域(東經(jīng)116°30'~125°47',北緯38°43'~45°00'之間)位于我國東北地區(qū)南部,流經(jīng)吉林、遼寧、河北省和內(nèi)蒙古自治區(qū)的部分市域,全流域面積21.9×104km2.該流域由兩個水系所組成:一為東、西遼河,于福德店匯流后為遼河
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