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應(yīng)用高通量測(cè)序DNA甲基化差異體液識(shí)別研究

發(fā)布時(shí)間:2022-02-24 19:51
  目的通過(guò)檢測(cè)和分析DNA甲基化差異的方法識(shí)別三種法庭科學(xué)犯罪現(xiàn)場(chǎng)常見體液(唾液斑、精液斑、血液斑)細(xì)胞來(lái)源。方法利用亞硫酸氫鹽法對(duì)唾液斑、精液斑、血液斑的DNA樣品進(jìn)行甲基化處理,對(duì)由文獻(xiàn)[1]和實(shí)驗(yàn)過(guò)程中篩選得到的甲基化位點(diǎn)進(jìn)行illumina高通量測(cè)序,檢測(cè)三種體液斑中細(xì)胞DNA的甲基化程度,并通過(guò)BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析每一個(gè)位點(diǎn)的甲基化程度與細(xì)胞來(lái)源的關(guān)系及全部檢測(cè)位點(diǎn)的甲基化程度聯(lián)合與細(xì)胞來(lái)源的關(guān)系。結(jié)果運(yùn)用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)35份樣品的73個(gè)位點(diǎn)的甲基化程度進(jìn)行訓(xùn)練和預(yù)測(cè),可以將唾液、精液、血液三種來(lái)源的DNA樣本分開,其準(zhǔn)確率達(dá)到77.3%。其中精細(xì)胞在L81528位點(diǎn)中表現(xiàn)為高甲基化,唾液和血液表現(xiàn)為低甲基化,可將精細(xì)胞準(zhǔn)確鑒別出來(lái)。結(jié)論本研究建立的高通量測(cè)序分析DNA甲基化差異的方法可通過(guò)增加檢測(cè)位點(diǎn)和樣品數(shù)量進(jìn)一步提高識(shí)別體液細(xì)胞來(lái)源的準(zhǔn)確率。 

【文章來(lái)源】:中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志. 2019,34(02)CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 樣本
    1.2 主要儀器與試劑
    1.3 方法
        1.3.1 DNA提取
        1.3.2 重亞硫酸鹽處理
        1.3.3 PCR擴(kuò)增篩選位點(diǎn)的特異片段
        1.3.4 Index PCR
        1.3.5 PCR產(chǎn)物純化回收
        1.3.6 測(cè)序及分析
2 結(jié)果
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]生物信息學(xué)在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用與展望[J]. 趙晶,唐暉,嚴(yán)江偉.  中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志. 2018(01)
[2]DNA甲基化在組織/體液來(lái)源鑒定中的研究進(jìn)展[J]. 賈雲(yún)舒,曹中圍,張文瓊,肖超,韋甜,易少華.  中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志. 2016(06)
[3]DNA甲基化標(biāo)記檢測(cè)方法及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J]. 周娣,王正,張霽,侯一平.  中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志. 2013(05)



本文編號(hào):3643401

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