本文關(guān)鍵詞：MicroRNA生物合成酶單核苷酸多態(tài)性與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系

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【摘要】：目的:結(jié)直腸癌是最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,近年來(lái)在包括中國(guó)在內(nèi)的亞洲國(guó)家,其發(fā)病率與死亡率均已呈逐年上升趨勢(shì)。Micro RNA(mi RNA)是一類(lèi)廣泛存在于真核生物中,長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸的小型非編碼RNA,mi RNA在許多生理病理過(guò)程中,如:胚胎發(fā)育,細(xì)胞的分化、增殖、凋亡以及腫瘤發(fā)展和激素分泌等過(guò)程都扮演著不可忽視的作用。單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異引發(fā)的DNA的多態(tài)性變化。Mi RNA相關(guān)單核苷酸多態(tài)性(mi RNA-related single nucleotide polymorphisms,mi R-SNPs),是指導(dǎo)致mi RNA基因調(diào)控功能紊亂的一類(lèi)功能型SNP的總稱(chēng),其可調(diào)節(jié)mi RNA及靶基因的表達(dá),從而影響腫瘤發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)、治療效果及預(yù)后。Mi R-SNPs包括:mi RNA核酸序列SNP,mi RNA生物合成酶SNP和mi RNA結(jié)合位點(diǎn)SNP。Mi RNA生物合成酶SNP與人類(lèi)腫瘤發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)關(guān)系密切,但關(guān)于其與結(jié)直腸癌關(guān)系的研究甚少。本研究對(duì)生物合成酶XPO5(rs11077),RAN(rs14035),Dicer(rs3742330),TNRC6B(rs9623117),GEMIN3(rs197412),GEMIN4(rs2740348)的SNP進(jìn)行測(cè)序分析,結(jié)合病例-對(duì)照研究,尋找與結(jié)直腸癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的特異SNP位點(diǎn),篩查易患結(jié)直腸癌的高危人群。方法:1研究對(duì)象:結(jié)直腸癌組患者為2006年1月~2008年12月間,在河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院外科住院的手術(shù)患者,經(jīng)內(nèi)鏡檢查、組織病理確診為結(jié)直腸癌,并行結(jié)直腸癌根治手術(shù)。結(jié)直腸癌組137例抗凝靜脈血標(biāo)本,均取自結(jié)直腸癌患者術(shù)前靜脈血樣;對(duì)照組134例抗凝靜脈血標(biāo)本,均來(lái)自2013年10月~2014年10月間,在河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院體檢的正常人,詳細(xì)記錄體檢資料,并除外與結(jié)直腸癌相關(guān)的疾病,取靜脈血樣。2基因組DNA提取:用DNA純化試劑盒(Promega,Madison,WI,USA)提取靜脈血標(biāo)本的基因組DNA,提取后置于4℃恒溫冰箱中保存?zhèn)溆谩?基因組DNA擴(kuò)增及mi R-SNP篩查:在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中查找與6個(gè)mi RNA生物合成酶相關(guān)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的目的基因,設(shè)計(jì)PCR擴(kuò)增引物,用PCR預(yù)混試劑盒進(jìn)行擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳證實(shí)后,送往上海捷瑞生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司用聚合酶鏈反應(yīng)-連接酶檢測(cè)反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)方法對(duì)XPO5(rs11077),RAN(rs14035),Dicer(rs3742330),TNRC6B(rs9623117),GEMIN3(rs197412),GEMIN4(rs2740348)的SNP位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)。4統(tǒng)計(jì)分析:采用t檢驗(yàn)(student t-test)比較計(jì)量資料,采用χ2檢驗(yàn)(Pearson Chi-Square test)對(duì)結(jié)直腸癌組和對(duì)照組的計(jì)數(shù)資料如性別、吸煙情況、飲酒情況、肥胖情況進(jìn)行比較。采用χ2檢驗(yàn)對(duì)結(jié)直腸癌組和對(duì)照組的生物合成酶XPO5(rs11077),RAN(rs14035),Dicer(rs3742330),TNRC6B(rs9623117),GEMIN3(rs197412),GEMIN4(rs2740348)的SNP位點(diǎn)基因型頻率進(jìn)行分析。所有數(shù)據(jù)均采用SPSS17.0(SPSS Inc.,Chicago,IL,USA)統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,P0.05被認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果:1對(duì)結(jié)直腸癌組與對(duì)照組的年齡、性別進(jìn)行比較,結(jié)果顯示兩組年齡(t=1.206,P=0.229)、性別(χ2=2.478,P=0.115)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),說(shuō)明結(jié)直腸癌組與對(duì)照組均衡可比。2對(duì)結(jié)直腸癌組與對(duì)照組吸煙情況、飲酒情況、肥胖情況進(jìn)行比較,結(jié)果顯示兩組吸煙情況(χ2=0.588,P=0.293)、飲酒情況(χ2=0.694,P=0.155)、肥胖情況(χ2=1.503,P=0.220),兩組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。3對(duì)mi RNA生物合成酶6個(gè)位點(diǎn)的SNP分布頻率分析顯示,在結(jié)直腸癌組與對(duì)照組之間,rs11077、rs14035、rs9623117、rs2740348多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行各組間比較,發(fā)現(xiàn)這四個(gè)位點(diǎn)SNP分布頻率無(wú)明顯差異。而對(duì)于Dicer基因的多態(tài)位點(diǎn)rs3742330,AA、AG+GG基因型在結(jié)直腸癌組中出現(xiàn)的頻率是55.5%和45.5%,而在對(duì)照組中出現(xiàn)的頻率為37.3%和62.7%,對(duì)于rs3742330位點(diǎn)AA基因型攜帶者相對(duì)AG+GG基因型攜帶者發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)為2.09倍(odds ratio,2.09;95%CI,1.29-3.40;P=0.003);對(duì)于GEMIN3基因的多態(tài)位點(diǎn)rs197412,TT、CT+CC基因型在結(jié)直腸癌組出現(xiàn)頻率為54.7%和45.3%,在對(duì)照組出現(xiàn)頻率為40.3%和59.7%,TT基因型攜帶者相對(duì)CT+CC基因型攜帶者具有更高的結(jié)腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(odds ratio,1.79;95%CI,1.11-2.90;P=0.017)。結(jié)論:1在結(jié)直腸癌組與對(duì)照組之間,Dicer基因的多態(tài)位點(diǎn)rs3742330的SNP和GEMIN3基因的多態(tài)位點(diǎn)rs197412的SNP分布頻率存在差異,此兩個(gè)位點(diǎn)可能是與結(jié)直腸癌發(fā)生相關(guān)的SNP位點(diǎn)。2 Mi RNA生物合成酶的單核苷酸多態(tài)性可以作為預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的分子標(biāo)志物。
【關(guān)鍵詞】：mi RNA相關(guān)單核苷酸多態(tài)性 結(jié)直腸癌 生物合成酶 GEMIN3 Dicer
【學(xué)位授予單位】：河北醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：R735.34
【目錄】：

• 中文摘要4-7
• 英文摘要7-10
• 英文縮寫(xiě)10-11
• 前言11-12
• 材料與方法12-21
• 結(jié)果21-23
• 附圖23-32
• 附表32-34
• 討論34-37
• 結(jié)論37-38
• 參考文獻(xiàn)38-42
• 綜述MicroRNA與結(jié)直腸癌關(guān)系的研究進(jìn)展42-54
• 參考文獻(xiàn)48-54
• 致謝54-55
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷55-56

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本文編號(hào)：590421