發(fā)布時間：2017-07-18 21:21

  本文關(guān)鍵詞：基于高通量測序技術(shù)對乳腺癌特征的研究及應(yīng)用前景

  更多相關(guān)文章： 乳腺癌 高通量測序 突變特征 顯著突變基因 拷貝數(shù)變異

【摘要】：背景：乳腺癌是世界上最常見的癌癥之一,也是中國女性中發(fā)病率最高的癌癥。近年來乳腺癌負(fù)擔(dān)年年增加。隨著高通量測序技術(shù)的不斷進(jìn)步,我們對乳腺癌的認(rèn)知程度以及診療水平有了長足的進(jìn)步�；驒z測篩查服務(wù)也幫助我們對自已的腫瘤遺傳風(fēng)險有了較好的認(rèn)識。結(jié)果：在本次研究中我們主要關(guān)注了公共網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫美國TCGA數(shù)據(jù)平臺中510例乳腺癌患者的突變數(shù)據(jù),以及773例乳腺癌的拷貝數(shù)數(shù)據(jù),利用mutsigCV軟件,找到了9個在這198例病人中具有突變顯著性的基因如：GATA3、MAP2K4,PTEN,RUNX1,CTCF, TBX3,AKT1.通過KEGG信號通路富集分析和NMF非負(fù)矩陣算法,發(fā)現(xiàn)了這些患者與TP53/PIK3CA突變患者在信號通路上的差異以及在突變特征上存在較大差異。通過GISTIC分析方法進(jìn)行顯著拷貝數(shù)變異區(qū)域及基因分析發(fā)現(xiàn)熱點突變區(qū)域,包括31個顯著擴(kuò)增區(qū)域51個顯著缺失區(qū)域和區(qū)域內(nèi)所包含的高頻突變基因,如CCND1、ERBB2、 PIK3CA RB1、CSMD1、CDKN2A、PTEN等結(jié)論：GATA3、MAP2K4、PTEN這些基因在有無TP53/PIK3CA突變的乳腺癌患者中發(fā)揮著不可或缺的重要作用,在非TP53/PIK3CA突變的患者中,存在一些新的基因突變,這些突變可能是這些患者致癌的關(guān)鍵因素。從患者所經(jīng)歷的突變過程,到突變所帶來的通路變化等層面予以闡述,說明同樣是乳腺癌,患者與患者間也存在很大的異質(zhì)性。CCND1, ERBB2, PIK3CA, RBI, CSMD1, CDKN2A, PTEN等基因的顯著缺失,印證了這些基因在乳腺癌中所扮演的重要角色,也發(fā)現(xiàn)其中部分基因在目前報道較少,這些基因有可能是前面那些基因的passenger,也有可能是新的癌基因或致癌基因。
【關(guān)鍵詞】：乳腺癌 高通量測序 突變特征 顯著突變基因 拷貝數(shù)變異
【學(xué)位授予單位】：華南理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R737.9;R440
【目錄】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-8
• 第一章 背景介紹8-25
• 1.1 乳腺癌及其危害8
• 1.2 乳腺癌的發(fā)病區(qū)域及發(fā)病年齡8-9
• 1.3 乳腺癌的死亡率和存活率9-10
• 1.4 乳腺癌的臨床診斷10-11
• 1.5 乳腺癌治療11-12
• 1.6 高通量測序技術(shù)的發(fā)展12-15
• 1.7 高通量測序技術(shù)在乳腺癌分子分型中的應(yīng)用15-17
• 1.8 高通量測序應(yīng)用于乳腺癌異質(zhì)性檢測的優(yōu)勢17-18
• 1.9 高通量測序技術(shù)在乳腺癌個體化治療中的應(yīng)用18-20
• 1.10 高通量測序技術(shù)對乳腺癌診療研究進(jìn)展20-25
• 第二章 本文研究內(nèi)容以及分析方法25-38
• 2.1 本文研究的數(shù)據(jù)來源25-28
• 2.2 乳腺癌體細(xì)胞突變分析方法28-33
• 2.2.1 材料30-31
• 2.2.2 數(shù)據(jù)分析方法31-33
• 2.3 拷貝數(shù)變異分析方法33-38
• 2.3.1 材料33
• 2.3.2 數(shù)據(jù)分析方法33-38
• 第三章 結(jié)果與結(jié)論38-51
• 3.1 乳腺癌體細(xì)胞突變分析結(jié)果38-45
• 3.1.1 信號通路分析結(jié)果38-40
• 3.1.2 顯著突變基因結(jié)果40-41
• 3.1.3 突變信號特征分析結(jié)果41-45
• 3.2 乳腺癌中的顯著拷貝數(shù)變異結(jié)果45-51
• 3.2.1 染色體臂層面的拷貝數(shù)變異45-47
• 3.2.2 局部區(qū)域的顯著CNV47-51
• 第四章 總結(jié)51-52
• 參考文獻(xiàn)52-55
• 致謝55-56
• 附件56

，

本文編號：559847