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CD28基因多態(tài)性與結直腸癌易感性的關聯(lián)研究

發(fā)布時間:2017-06-23 17:14

  本文關鍵詞:CD28基因多態(tài)性與結直腸癌易感性的關聯(lián)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的:對人群中CD28等位基因位點上rs3116496及rs3181098多態(tài)性與結直腸癌易感性的關系進行分析研究。方法:本實驗采用病例-對照研究。選取2013年2月-2015年2月,就診于河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院符合該實驗條件的對象,其中結腸癌病人102例、直腸癌病人138例、正常人群147例。在患者知情同意的情況下,收集患者腫瘤疾病家族史和性別、年齡、吸煙史、飲酒史一般情況等信息。在無菌操作原則下采集5ml外周靜脈血,應用蛋白酶K消化-氯化鈉飽和鹽析法提取白細胞中脫氧核糖核酸DNA;應用限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈反應技術(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)對CD28基因rs3116496、rs3181098兩個SNP單核苷酸多態(tài)性位點的基因型及等位基因進行檢測分析。對實驗結果的統(tǒng)計學分析使用SPSS13.0版軟件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA):t檢驗方法分析病例-對照組間年齡差異;χ2檢驗方法分析病例-對照組間的性別差異、等位基因分布頻率及基因型分布頻率;logistic回歸方法計算OR相對風險度的比值比(odds ratio,OR)和95%CI可信區(qū)間(confidence interval,CI);Hardy-Weinberg檢驗病例-對照組間基因型分布頻率的遺傳連鎖平衡。對CD28基因的rs3116496 C/T、rs3181098 A/G兩個SNPs位點應用2LD軟件和EH軟件進行聯(lián)合分析,顯著性差異的標準取P0.05。結果:1對照組中rs3116496 C/T、rs3181098 A/G基因型分布頻率均符合Hardy-Weinberg遺傳連鎖平衡(P0.05)。2結直腸癌發(fā)病風險與rs3116496 C/T基因多態(tài)性在正常對照組中CD28基因rs3116496 C/T位點上等位基因C和T分布頻率為6.1%和93.9%;在直腸癌組中等位基因C和T分布頻率為11.6%和88.4%;在結腸癌組中等位基因C和T分布頻率為10.8%和89.2%。直腸癌組及結腸癌組分別與正常對照組相比,差異均具有統(tǒng)計學意義(P分布為0.021,0.049)。TT、CT兩種基因型在直腸癌組中的分布頻率分別為78.1%和21.9%;TT、CT兩種基因型在結腸癌組中分布頻率分別為82%和18%;TT、CT兩種基因型在正常對照組中分布頻率分別為87.8%和12.2%。TT、CT兩種基因型在直腸癌組與正常對照組相比,差異具有統(tǒng)計學意義(P為0.03)。而TT、CT兩種基因型在結腸癌組與與正常對照組相比,差異無統(tǒng)計學意義(P為0.208)。與攜帶TT基因型相比,攜帶CT基因型罹患直腸癌的發(fā)病風險顯著增加(OR=2.009,95%CI=1.062-3.803)。3結直腸癌發(fā)病風險與rs3181098A/G基因多態(tài)性在直腸癌組中CD28基因rs3181098A/G位點上等位基因G和A分布頻率分別為78.6%和21.4%;在結腸癌組中等位基因G和A分布頻率分別為76.5%和23.5%;在正常對照組中等位基因G和A分布頻率分別為75.9%和24.1%。直腸癌組及結腸癌組等位基因G和A分布頻率分別與正常對照組等位基因G和A分布頻率相比,差異均無統(tǒng)計學意義(P分別為0.430和0.873)。GG、AG兩種基因型在直腸癌中的分布頻率分別為64.4%和35.6%;GG、AG兩種基因型在結腸癌中分布頻率分別為62.5%和37.5%;而GG、AG兩種基因型在正常對照組中分布頻率則為62.8%和37.2%。直腸癌組及結腸癌組GG、AG兩種基因型分布頻率分別與正常對照組對比,差異均無統(tǒng)計學意義(P分別為0.783和0.966)。與攜帶GG基因型相比,攜帶AG基因型罹患結直腸癌的風險未見增高無統(tǒng)計學意義(OR=0.932,95%CI=0.567-1.533;OR=1.012,95%CI=0.590-1.735).4采用EH軟件和2LD軟件對CD28基因的rs3116496 C/T、rs3181098 A/G兩個SNPs位點進行聯(lián)合分析。在結直腸癌病例組中rs3116496 C/T、rs3181098 A/G之間存在連鎖不平衡關系(D'=0.994),其中在正常健康組出現頻率最高的單體型是rs3116496T-rs3181098G(69.7%),其次為rs3116496T-rs3181098A(24.1%)、rs3116496C-rs3181098G(6.1%)和rs3116496C-rs3181098A(0%)。單體型為rs3116496C-rs3181098A、rs3116496C-rs3181098G可增加結直腸癌發(fā)病風險(OR=86.208,95%CI=4.834-1537.469;OR=1.806,95%CI=1.032-3.519);而rs3116496T-rs3181098A(OR=0.864,95%CI=0.612-1.219)、rs3116496T-rs3181098G(OR=0.889,95%CI=0.649-1.216)單體型可能與結直腸癌發(fā)病風險無關。結論:1 CD28基因rs3116496 C/T位點的多態(tài)性可能與我國北方結直腸癌易感性相關:rs3116496等位基因C增加了結直腸癌的發(fā)病風險;與TT相比CT基因型增加了直腸癌的發(fā)病風險。2 CD28基因rs3181098A/G位點的多態(tài)性可能與我國北方結直腸癌易感性無關。3在結直腸癌中CD28基因的rs3116496 C/T、rs3181098A/G兩個位點之間存在連鎖不平衡現象。單體型rs3116496C-rs3181098A、rs3116496C-rs3181098G可增加結直腸癌發(fā)病風險。
【關鍵詞】:結直腸癌(CRC) CD28 單核苷酸多態(tài)性(SNP) 遺傳易感性
【學位授予單位】:河北醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R735.34
【目錄】:
  • 中文摘要4-7
  • 英文摘要7-10
  • 前言10-12
  • 材料與方法12-19
  • 結果19-22
  • 附圖22-25
  • 附表25-27
  • 討論27-30
  • 結論30-31
  • 參考文獻31-35
  • 綜述 CD28與腫瘤的研究進展35-44
  • 參考文獻41-44
  • 致謝44-45
  • 個人簡歷45

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