人即刻早期反應(yīng)基因2(immediate early response 2,IER2)可能參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展,但它在此過程中的作用及表達調(diào)控的機制仍不清楚。本研究通過在線數(shù)據(jù)庫GEPIA2與Kaplan-Meier Plotter分析發(fā)現(xiàn):TNF和IER2基因在食管癌組織和宮頸癌組織中高表達。而且IER2基因高表達的食管癌病人的預(yù)后顯著較差。通過UCSC基因組數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),在宮頸癌細胞和淋巴細胞內(nèi),TNFα(由TNF基因編碼)誘導(dǎo)激活NF-κB結(jié)合IER2基因區(qū)。qRT-PCR檢測證明,在食管癌和宮頸癌等細胞內(nèi),TNFα誘導(dǎo)NF-κB在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)IER2基因的表達。本文據(jù)此提出,TNFα誘導(dǎo)NF-κB上調(diào)IER2基因的表達可能是其在食管癌和宮頸癌等腫瘤中高表達的調(diào)控機制。本研究還通過在線數(shù)據(jù)庫GeneMANIA和String分析發(fā)現(xiàn)11個與IER2具有關(guān)聯(lián)性的基因。通過在線數(shù)據(jù)庫Oncomine分析發(fā)現(xiàn)了88個基因在食管癌細胞內(nèi)與IER2基因共表達。其中,包含7個與IER2具有關(guān)聯(lián)性的基因ATF3、DUSP1、EGR1、EGR2、FOSB、JUN、NR4A1。本研究通過Oncomi...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 細胞培養(yǎng)及處理
    1.3 NF-κB結(jié)合IER2的特征分析
    1.4 腫瘤組織細胞中IER2的表達分析
    1.5 腫瘤病人生存周期分析
    1.6 與IER2具有關(guān)聯(lián)性基因的分析
    1.7 熒光定量PCR
    1.8 與IER2共表達的基因及其Gene Ontology(GO)注釋
    1.9 CCK8法檢測腫瘤細胞生長增殖
    1.10統(tǒng)計學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 IER2在腫瘤組織及相應(yīng)正常組織中的表達
    2.2 IER2基因區(qū)內(nèi)NF-κB的結(jié)合特征
    2.3 TNFα誘導(dǎo)NF-κB調(diào)控IER2基因表達
    2.4 腫瘤細胞高表達的IER2基因功能注釋
3 討論



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