乳腺癌是全球女性最常見的惡性疾病。隨著診療手段的不斷提高,原發(fā)性乳腺癌對(duì)患者的生命威脅已得到有效控制,相比之下,乳腺癌發(fā)生轉(zhuǎn)移則會(huì)導(dǎo)致患者死亡,且成為首要原因。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),乳腺腫瘤細(xì)胞有向特定器官轉(zhuǎn)移的傾向性,肺部是乳腺癌最常見的轉(zhuǎn)移部位之一。我們希望能通過(guò)有限的生物標(biāo)志物來(lái)識(shí)別具有高度肺轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)的乳腺癌患者。經(jīng)過(guò)對(duì)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的全面檢索,我們得到了符合研究標(biāo)準(zhǔn)的兩個(gè)數(shù)據(jù)集:GSE5327和GSE2603。在訓(xùn)練集GSE5327中,我們通過(guò)單基因log-rank檢驗(yàn)初步篩選出與乳腺癌肺轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因,并對(duì)這些基因進(jìn)行GO生物功能和KEGG信號(hào)通路富集分析。通過(guò)一種穩(wěn)健的基于似然函數(shù)的生存分析建模方法,我們確定了用于構(gòu)建乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖的最佳基因。在模型構(gòu)建完成之后,我們?cè)谟?xùn)練集GSE5327和驗(yàn)證集GSE2603中分別對(duì)該預(yù)測(cè)列線圖的有效性進(jìn)行了評(píng)估。通過(guò)初步的單因素生存分析,共有319個(gè)基因被認(rèn)為與乳腺癌的肺轉(zhuǎn)移有關(guān)。同時(shí),這些基因所富集的GO生物功能和KEGG信號(hào)通路也得到確認(rèn)。通過(guò)rbsurv算法,我們選擇了其中6個(gè)最優(yōu)基因來(lái)構(gòu)建乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖:GOLGB1,T...

【文章頁(yè)數(shù)】：52 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 引言
    1.1 概述
    1.2 乳腺癌
        1.2.1 轉(zhuǎn)移性乳腺癌簡(jiǎn)介
        1.2.2 轉(zhuǎn)移性乳腺癌的精準(zhǔn)治療
    1.3 生物信息學(xué)
        1.3.1 高通量測(cè)序技術(shù)
        1.3.2 GEO數(shù)據(jù)庫(kù)(Gene Expression Omnibus)
        1.3.3 生物信息學(xué)分析是篩選乳腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的重要手段
    1.4 信號(hào)通路的富集分析與WebGestalt
    1.5 生存分析
        1.5.1 生存曲線和log-rank檢驗(yàn)
        1.5.2 穩(wěn)健的基于似然比的生存分析建模方法
        1.5.3 時(shí)間依賴的ROC曲線
第2章 材料與方法
    2.1 從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)獲取微陣列數(shù)據(jù)集
    2.2 數(shù)據(jù)分析與方法
        2.2.1 數(shù)據(jù)的預(yù)處理
        2.2.2 初步篩選與乳腺癌肺轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因
        2.2.3 構(gòu)建乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖
        2.2.4 對(duì)乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖的內(nèi)部驗(yàn)證和外部驗(yàn)證
        2.2.5 對(duì)乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖中基因的初步探索
第3章 結(jié)果
    3.1 初步篩選與乳腺癌肺轉(zhuǎn)移有關(guān)的基因
    3.2 確定最佳基因并構(gòu)建乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖
    3.3 乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖的內(nèi)部驗(yàn)證和外部驗(yàn)證
    3.4 對(duì)乳腺癌無(wú)肺轉(zhuǎn)移生存列線圖中基因的初步探索
第4章 討論
第5章 結(jié)論與展望
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
綜述
    參考文獻(xiàn)



本文編號(hào)：3822561