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ILs基因SNPs與胃癌易感性關聯(lián)及生物信息學功能研究

發(fā)布時間:2023-03-04 17:47
  胃癌是發(fā)病率及致死率極高的一種惡性腫瘤,影響全世界人群的健康。中國作為全球胃癌高發(fā)區(qū)之一,每年因胃癌所致的健康及經(jīng)濟負擔極大。多數(shù)胃癌早期不易發(fā)現(xiàn),嚴重影響胃癌病人的治療及預后,給病人帶來極大的生理及精神痛苦。因此,研究胃癌的易感性是十分必要的。單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是一類重要的突變,很多基因的SNPs與胃癌易感性相關,可以作為胃癌易感性相關的生物標志物。炎癥影響胃癌的發(fā)生、發(fā)展,而白細胞介素(白介素),是一類炎癥相關的重要細胞因子。研究表明白介素(Interleukin,IL)基因的SNPs對胃癌的易感性也會產(chǎn)生影響。雖然已經(jīng)發(fā)現(xiàn)多種ILs基因的SNPs與胃癌易感性相關,但現(xiàn)有的關于ILs基因SNPs與胃癌易感性的研究結果間仍存在爭議。目的通過meta分析的方法找出與胃癌易感性有關的ILs基因單核苷酸多態(tài)性位點,并對篩選出的SNPs在河南省漢族人群樣本中進行實驗,驗證其與胃癌易感性的關系,最后通過生物信息學等方法初步探索與胃癌易感性相關位點突變對生物學功能可能產(chǎn)生的影響。方法(1)基于meta分析的方法定量評價ILs基因...

【文章頁數(shù)】:90 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
2 材料與方法
    2.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關聯(lián)研究的meta分析
        2.1.1 文獻檢索與收集
        2.1.2 文獻納入
        2.1.3 文獻資料分析、質(zhì)量評價
        2.1.4 統(tǒng)計學分析
    2.2 生物學實驗
        2.2.1 實驗儀器
        2.2.2 實驗試劑
        2.2.3 溶液的配制
        2.2.4 研究方法
        2.2.5 統(tǒng)計學分析
    2.3 基因分型實驗驗證后胃癌易感性相關SNPs的生物學功能初探
3 結果
    3.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關聯(lián)的meta分析
        3.1.1 文獻檢索結果
        3.1.2 ILs基因SNPs及相應文獻的基本信息
        3.1.3 Meta分析結果
        3.1.4 敏感性分析
        3.1.5 發(fā)表偏倚分析
    3.2 基因分型實驗結果分析
        3.2.1 研究對象一般特征
        3.2.2 SNPs的分型結果
        3.2.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗
        3.2.4 兩個SNPs和胃癌遺傳易感性的關系
        3.2.5 兩個SNPs與胃癌遺傳易感性的分層分析
        3.2.6 假陽性報告率分析及人群歸因危險度百分比評估
        3.2.7 基因環(huán)境交互作用
    3.3 rs763780的生物學功能初探
        3.3.1 rs763780三維染色質(zhì)環(huán)作用關系
        3.3.2 rs763780所致蛋白質(zhì)功能影響預測
4 討論
    4.1 本研究概述
    4.2 ILs基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌的關系
    4.3 基因-環(huán)境交互作用對胃癌的影響
    4.4 基于生物信息學的rs763780生物學功能初探
    4.5 本研究優(yōu)點及局限性
5 結論
參考文獻
綜述 白細胞介素:胃癌相關信號通路的重要調(diào)控因子
    1 白細胞介素簡介
    2 白細胞介素與常見惡性腫瘤的關系
    3 常見胃癌相關信號通路
    4 白細胞介素參與影響胃癌發(fā)生、發(fā)展等過程的信號通路
    參考文獻
個人簡歷及學術論文發(fā)表情況
致謝



本文編號:3754718

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