發(fā)布時間：2022-01-03 17:51

　　【目的】檢測DDX31在結(jié)直腸癌組織中的表達情況,探究DDX31對結(jié)直腸癌細胞功能和結(jié)直腸癌細胞系SW480在裸鼠體內(nèi)成瘤的影響,為結(jié)直腸癌在基因治療方面提供理論基礎(chǔ)�！痉椒ā康谝徊糠�:（1）.從TCGA數(shù)據(jù)庫,Oncomine數(shù)據(jù)庫下載數(shù)據(jù),并對結(jié)直腸癌中DDX31的表達量進行分析,再結(jié)合數(shù)據(jù)庫中的臨床信息,分析DDX31表達水平與患者預后之間的相關(guān)性;（2）.收集結(jié)直腸癌患者信息及腫瘤樣本,并進行了免疫組化檢測,分析DDX31的表達水平與患者臨床特征之間的相關(guān)性。第二部分:（1）.設(shè)計DDX31的siRNA,并在SW480細胞系中檢測沉默效率;（2）.選擇沉默效率最高的siRNA轉(zhuǎn)染SW480細胞系,利用CCK-8法檢測沉默DDX31的SW480細胞與對照組細胞的增殖,利用流式細胞儀分析兩組細胞的凋亡和周期,采用transwell chamber進行細胞侵襲實驗檢測兩組細胞的侵襲能力,采用細胞劃痕的方法定性檢測DDX31對結(jié)直腸癌細胞遷移能力的影響。第三部分:（1）.獲取DDX31干擾序列基因片段,進行慢病毒載體的重組質(zhì)粒構(gòu)建,然后進行慢病毒包裝及滴度的檢測,利用慢病毒轉(zhuǎn)染SW48... 

【文章來源】：蘇州大學江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：87 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

TCGA數(shù)據(jù)聚類熱圖，TCGA數(shù)據(jù)庫關(guān)于結(jié)直腸癌(286例結(jié)直腸癌患者以及41例正常對照)的差異表達基因（|logFC|>1，P<0.05）（前50高表達以及前50低表

DDX31的mRNA水平在結(jié)直腸癌患者中較正常組明顯增加，數(shù)據(jù)來源于TCGA數(shù)據(jù)庫

圖 3. DDX31 在多種腫瘤中表達均有上調(diào), 橫坐標為不同的腫瘤，縱坐標為 mRNA 水平，紅色為腫瘤組，藍色為正常組二、Oncomine 數(shù)據(jù)庫中驗證 DDX31 在結(jié)直腸癌組織中表達上調(diào)在 TCGA 數(shù)據(jù)庫中，發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌患者中 DDX31 表達明顯上調(diào)，另外，DDX31在其他腫瘤組織中也出現(xiàn)上調(diào)。接著，利用 Oncomine 數(shù)據(jù)庫（也稱為癌癥微陣列數(shù)據(jù)庫和整合數(shù)據(jù)挖掘平臺，通過整合己經(jīng)發(fā)表的利用 DNA 微陣列技術(shù)分析腫瘤基因組的數(shù)據(jù)，形成一個統(tǒng)一的生物信息學資源庫，使得各主要的癌癥類型和相應的正常組織的基因進行差異表達分析）對單個基因即 DDX31 的表達量進行查詢并可視化，發(fā)現(xiàn) DDX31 在結(jié)直腸癌患者中也出現(xiàn)上調(diào)（圖 4），差異具有統(tǒng)計學意義。


本文編號：3566706