嬰兒血管瘤長(zhǎng)鏈非編碼RNA與mRNA表達(dá)譜分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-30 11:20
目的研究增殖期與消退期嬰兒血管瘤(IH)長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)與mRNA的差異表達(dá)情況。方法 2019年1-3月在四川大學(xué)華西醫(yī)院小兒外科收集行手術(shù)切除治療的8例IH組織(增殖期與消退期各4例),運(yùn)用基因芯片技術(shù)篩選差異表達(dá)(P < 0.05,差異倍數(shù)≥ 1.5)lncRNA和mRNA,并用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)對(duì)芯片結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。同時(shí),應(yīng)用生物信息學(xué)方法,對(duì)差異基因進(jìn)行GO功能和KEGG通路分析,并構(gòu)建lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),預(yù)測(cè)差異lncRNA的順式作用靶基因。結(jié)果通過(guò)基因芯片技術(shù)共篩選出405條差異lncRNA(108條下調(diào),297條上調(diào))與772條差異mRNA(107條下調(diào),665條上調(diào))。qRT-PCR驗(yàn)證4條lncRNA(n335248、ENST00000450864、n333319和n335185)與4條mRNA(EDNRA、IFI6、HK2與ITGA1)的表達(dá),結(jié)果與基因芯片檢測(cè)結(jié)果一致。GO與KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),差異mRNA主要參與血管凝固、軸突導(dǎo)向、血管生成和細(xì)胞黏附等生物過(guò)程,差異mRNA主要富集在代謝通路、細(xì)胞局部黏...
【文章來(lái)源】:中華皮膚科雜志. 2020,53(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]嬰兒血管瘤發(fā)病過(guò)程中的關(guān)鍵信號(hào)通路[J]. 楊開(kāi)穎,陳思源,吉毅. 國(guó)際皮膚性病學(xué)雜志. 2017 (06)
本文編號(hào):3558091
【文章來(lái)源】:中華皮膚科雜志. 2020,53(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]嬰兒血管瘤發(fā)病過(guò)程中的關(guān)鍵信號(hào)通路[J]. 楊開(kāi)穎,陳思源,吉毅. 國(guó)際皮膚性病學(xué)雜志. 2017 (06)
本文編號(hào):3558091
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