目的:本研究利用TCGA公共數(shù)據(jù)庫肺腺癌患者RNA-seq數(shù)據(jù)集分析EGFR突變對腫瘤微環(huán)境（Tumor Microenvironment,TME）的影響以及與分泌型磷蛋白1（secreted phosphoprotein 1,SPP1）介導免疫逃逸的相關性,為指導臨床治療提供新的思路。方法:通過卡方檢驗或Fisher確切概率法分析不同臨床特征間在EGFR基因突變率的差異。采用Wilcoxon秩和檢驗對比腫瘤組織和癌旁組織,以及EGFR突變型和野生型患者SPP1的表達差異。利用CIBERSORT分析TCGA肺腺癌患者22種免疫細胞浸潤情況,分別對比EGFR基因突變以及SPP1表達差異對免疫細胞浸潤影響。本研究使用R（3.4.3版本）和SPSS軟件（26.0版本）進行分析和作圖,以P<0.05表示差異具有統(tǒng)計學意義。結果:1.EGFR基因突變與患者臨床特征的關系EGFR基因突變率在不同性別存在差異,女性較男性更容易發(fā)生（P=0.002）。不同年齡組、種族、TNM、Stage分期的患者EGFR基因突變率未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計學差異。TP53野生型和突變型患者伴隨EGFR突變概率未觀察到顯著差異（... 

【文章來源】：河北醫(yī)科大學河北省

【文章頁數(shù)】：41 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

EGFR野生型（藍）與EGFR突變型（紅）患者TME中22種免疫細胞浸潤差異Fig.1Differencesininfiltrationof22typesofimmunecellsinTMEbetween

14圖2.不同組織SPP1表達情況Fig.2ExpressionofSPP1indifferenttissuesTheexpressionofSPP1intumortissuesaresignificantlyhigherthanparacanceroustissues（A）,andtheexpressionofSPP1inEGFRmutantpatientsaresignificantlyhigherthanEGFRwild-typepatients（B）4.SPP1高表達組與低表達組22種免疫細胞浸潤差異為了研究SPP1的表達水平對免疫微環(huán)境的影響，我們運用CIBERSORT探索了高和低SPP1表達組中22種免疫細胞浸潤比例的差異情況。結果如圖3所示，低表達組208例和高表達組232例符合篩選標準。與低表達組相比，SPP1高表達組靜止的NK細胞（P=0.047），M0型巨噬細胞（P<0.001），M2型巨噬細胞（P=0.0014），嗜中性粒細胞（P<0.001）所占比例更高。相反，與高表達組相比，SPP1低表達組幼稚B細胞（P=0.025），記憶B細胞（P=0.012），CD8+T細胞（P<0.001），記憶性CD4+T細胞（P=0.019），濾泡輔助性T細胞（P=0.039），激活的NK細胞（P=0.033），激活的樹突狀細胞（P=0.0083），靜止的肥大細胞（P<0.001）所占比例更高。因此，這些發(fā)現(xiàn)表明SPP1高表達組M2型巨噬細胞所占比例明顯更高，CD8+T細胞，B細胞，濾泡輔助性T細胞，NK細胞以及激活的樹突狀細胞等免疫效應細胞浸潤程度較少。

15圖3SPP1低表達（藍）與SPP1高表達（紅）患者TME中22種免疫細胞浸潤差異Fig.3Differencesininfiltrationof22typesofimmunecellsinTMEbetweenSPP1lowexpression(blue)vsSPP1highexpression(red)patients5.SPP1表達與免疫細胞浸潤的相關性分析我們對SPP1表達與不同免疫細胞浸潤程度的Spearman相關性分析發(fā)現(xiàn)，發(fā)現(xiàn)SPP1的表達增加與CD8+T細胞（r=-0.374）、中央型CD4+記憶T細胞（r=-0.236）、濾泡輔助T細胞（r=-0.276）、激活的NK細胞（r=-0.208）、激活的樹突狀細胞（r=-0.157）浸潤程度呈負相關；與巨噬細胞（r=0.405）、M2型巨噬細胞（r=0.285）、靜止的樹突狀細胞（r=0.155）呈正相關。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]常用腫瘤基因分析方法及基于TCGA數(shù)據(jù)庫的分析應用[J]. 李鑫,李夢瑋,張依楠,徐寒梅.  遺傳. 2019(03)



本文編號：3499978