目的對1例食管癌術(shù)后放化療患者口腔感染的霍亂弧菌進行菌株鑒定和病原特征分析。方法取患者口腔分泌物進行分離培養(yǎng)并觀察細菌形態(tài)特征,用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜（MALDI-TOF MS）進行蛋白質(zhì)水平鑒定,并進行血清群檢測;用K-B紙片擴散法進行藥敏試驗;提取細菌基因組DNA構(gòu)建文庫并進行細菌基因組重測序,通過核糖體多位點序列分型（r MLST）、平均核苷酸相似度（ANI）分析和非冗余蛋白質(zhì)庫（NR）比對,對菌株進行分子生物學鑒定,并進一步對其MLST分子分型和毒力基因進行分析。結(jié)果 MALDI-TOF MS鑒定分值為2.151,r MLST分析顯示該菌株與霍亂弧菌吻合度為100%,ANI分析顯示ANIb值為96.05%,ANIm值為96.56%,NR數(shù)據(jù)庫基因注釋得到霍亂弧菌相關(guān)的基因2 981個,血清群檢測為非O1/O139群霍亂弧菌。藥敏試驗結(jié)果顯示該菌對哌拉西林/他唑巴坦、氨曲南、頭孢哌酮/舒巴坦、頭孢他啶、頭孢吡肟、慶大霉素、阿米卡星、左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、亞胺培南、美羅培南均敏感。MLST顯示該菌株為新的ST型（ST-986）,且攜帶tox R、hly A、nan H、... 

【文章來源】：臨床檢驗雜志. 2020,38(11)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

細菌培養(yǎng)和革蘭染色形態(tài)特征

細菌全基因組重測序分析

霍亂弧菌分離株的最小生成樹分析


本文編號：3079399