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FNDC3B circular RNA通過調控CD44的表達促進胃癌細胞遷移和侵襲

發(fā)布時間:2021-01-14 08:30
  目的:環(huán)狀RNA(circRNA)是一類由5’和3’末端共價連接形成的環(huán)狀RNA分子,研究表明其在人類癌癥中起著重要的調控作用,但circRNA在胃癌中的相關研究仍鮮少報道。本研究發(fā)現(xiàn)FND3B環(huán)狀RNA(circFNDC3B)表達水平在胃癌組織中下降,提示circFNDC3B在胃癌發(fā)生發(fā)展過程中可能發(fā)揮著重要的作用。因此,本文以兩種具有不同的circFNDC3B表達水平的胃癌細胞為主要的研究對象來探索circFNDC3B在胃癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用與分子機制。方法:首先,利用qRT-PCR驗證circFNDC3B在胃癌臨床樣本和胃癌細胞系中的表達水平;其次,采用無縫克隆技術構建circFNDC3B過表達載體和siRNA技術分別對MGC-803細胞和BGC-823細胞進行circFNDC3B表達水平的介入干擾,再通過一系列western blot、劃痕實驗、transwell實驗和qRT-PCR等實驗對circFNDC3B在胃癌細胞中的表型和功能作用進行探究;最后,采用RNA結合蛋白免疫沉淀分析(RIP)和RNApull-down實驗分析證實circFNDC3B與IGF2BP3、CD44... 

【文章來源】:廈門大學福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】:84 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

FNDC3B circular RNA通過調控CD44的表達促進胃癌細胞遷移和侵襲


圖1.?circRNAs生物合成模型

模型圖,環(huán)化,模型,互補序列


雙鏈RNA通過解鎖莖環(huán)結構以拮抗circRNAs的生物發(fā)生[18]。隨著探索circRNAs??生物合成的持續(xù)進展,張等人提出了類似于可變剪接的可變環(huán)化模型以系統(tǒng)性地??解釋circRNAs的生成機制[7](如圖2所示)。在RNA配對過程中,重復或非重??復的側翼內含子互補序列的競爭會影響剪接選擇和外顯子環(huán)化,且橫跨于側翼內??含子的互補序列可明顯促進外顯子的環(huán)化。反向互補序列可以導致多個circRNAs??來源于同一個基因的轉錄本。由于互補序列在不同物種間的分布不同,可變環(huán)化??可導致物種之間的特異性環(huán)化;パa序列的存在可促進轉錄本通過可變環(huán)化形成??circRNAs,但互補序列對于外顯子環(huán)化來說是必要但不充分條件[7],這個模型暗??示可變環(huán)化的復雜性和circRNAs的多樣性,且一定程度上可能受其他因素的影??響,如RBPs正向或負向調控circRNAs的形成[5]。??2??

胃癌組織,表達水平,細胞系,細胞


利用qRT-PCR檢測5種胃癌細胞系(GES-l,AGS,SGC-7901,??MGC-803,?BGC-823)中?circFNDC3B?表達水平的差異,發(fā)現(xiàn)?circFNDC3B?的表??達水平在不同細胞系中呈現(xiàn)出不同的表達水平,結果如圖3.2所示。SGC-7901??細胞和MGC-803細胞中circFNDC3B的表達水平明顯低于GES-1細胞(正常胃??粘膜細胞系),分別為p<〇.〇〇〇l和P=〇.〇〇32,但BGC-823細胞的表達水平卻明??顯高于GES-1細胞(p=0.0007)。此外,本文還分析了每個細胞系中的FNDC3B??mRNA的表達水平,結果顯示在MGC-803細胞中FNDC3B?mRNA明顯增加??32??

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu.  World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[2]Minute signet ring cell carcinoma occurring in gastric hyperplastic polyp[J]. Shoji Hirasaki,Seiyuu Suzuki,Hiromitsu Kanzaki,Kohei Fujita,Shuji Matsumura,Eiji Matsumoto.  World Journal of Gastroenterology. 2007(43)
[3]Frequent loss of heterozygosity at 8p22 chromosomal region in diffuse type of gastric cancer[J]. Hedayat Allah Hosseini,Ali Ahani,Hamid Galehdari,Ali Mohammad Froughmand,Masoud Hosseini,Abdolrahim Masjedizadeh,Mohammad Reza Zali.  World Journal of Gastroenterology. 2007(24)



本文編號:2976572

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